Integrating in silico and in vitro approaches: Cytotoxicity and enzymatic activity of xenobiotics in different fish cell lines

Abstract

Bu çalışmada, beş kantitatif yapı-toksisite ilişkisi (QSTR) modeli geliştirilmiştir. Çeşitli kimyasalların Poeciliopsis lucida hepatokarsinom hücre dizisi (PLHC-1) kullanılarak üç farklı test - etoksiresorufin-O-deetilaz enzimi (EROD), neutral red (NR) ve 3-(4, 5-dimethylthiazol-2-yl)-2, 5-diphenyl tetrazolyum bromit (MTT) ile sitotoksisitesi ölçülmüş ve bu veriler kullanılarak üç QSTR modeli geliştirilmiştir. EROD, NR and MTT testleri sırasıyla enzimatik aktivite, lizozomal hasar ve mitokondriyal aktiviteyi göstermektedir. Diğer iki QSTR modeli ise akvaryum balığı (GFS), Carassius auratus'un pul dokusuna ve fathead minnow (FHM), Pimephales promelas'ın epitel hücre dizisine ait NR verisi kullanılarak geliştirilmiştir. Modellerdeki tanımlayıcılar QSARINS 2.2.1 yazılımında bulunan araçlarla seçilmiştir. Tüm QSTR modelleri Ekonomik İşbirliği ve Kalkınma Örgütü'nün (OECD) belirlediği ilkelerle uyumlu olacak şekilde geliştirilmiş ve dâhili ve harici olarak doğrulanmıştır. pEC50,EROD[PLHC-1] modeli bir tanımlayıcı, pEC50,NR[GFS] modeli iki ve pEC50,NR[PLHC-1], pEC50,NR[FHM] ve pEC50,MTT[PLHC-1] modellerinin her biri üçer tanımlayıcılıdır ve bu tanımlayıcılar DRAGON 6.0 yazılımı ile hesaplanan tanımlayıcılardır. Geliştirilen QSTR modellerinin tahmin performansı, farklı yapıda ve deneysel sitotoksisite verisi bulunmayan kimyasalların oluşturduğu birer harici set ile test edilmiştir. pEC50,NR[PLHC-1], pEC50,NR[GFS], pEC50,MTT[PLHC-1], pEC50,EROD[PLHC-1] ve pEC50,NR[FHM] modellerinin harici set kimyasallarını yapısal olarak kapsama yüzdeleri sırasıyla %98.6, %95.0, %98.3, %92.1 ve %89.1 olarak bulunmuştur. Fathead minnow modeli dışında, harici set kimyasalları için deneysel in vivo ve tahmin edilen in vitro değerleri arasında orta veya güçlü korelasyon gözlemlenmiştir. Bu çalışmada geliştirilen QSTR modelleri, çeşitli kimyasalların akut balık toksisitelerinin değerlendirilmesinde bir hızlı öntarama ve önceliklendirme sağlayabilir ve kapsamlı toksisite testlerine olan ihtiyacı azaltabilir.

In the present study, five Quantitative Structure-Toxicity Relationship (QSTR) models were generated. Three QSTR models were developed for the cytotoxcity (pEC50) of diverse chemicals to Poeciliopsis lucida hepatocarcinoma cell line (PLHC-1) measured with three assays, namely ethoxyresorufin-O-deethylase enzyme (EROD), neutral red (NR) and 3-(4, 5-dimethylthiazol-2-yl)-2, 5-diphenyl tetrazolium bromide (MTT) assays. EROD, NR and MTT assays reflects enzymatic activity, lysosomal and mitochondrial activity, respectively. The other two QSTR models were generated using the NR data for goldfish (GFS), Carassius auratus, scale tissue and fathead minnow (FHM), Pimephales promelas, epithelial cell line. Descriptors appearing in each model were selected via the tools implemented in QSARINS 2.2.1 software. All QSTR models were generated in line with the Organization of Economic Co-operation Development (OECD) principles and validated both internally and externally. pEC50,EROD[PLHC-1] model had one descriptor, pEC50,NR[GFS] had two and each of pEC50,NR[PLHC-1], pEC50,NR[FHM] and pEC50,MTT[PLHC-1] models had three descriptors from DRAGON. The external predictivity of the generated QSTR models were tested using structurally diverse chemicals with no experimental cytotoxicity data. Structural coverage of the pEC50,NR[PLHC-1], pEC50,NR[GFS], pEC50,MTT[PLHC-1], pEC50,EROD[PLHC-1] and pEC50,NR[FHM] models for the external set compounds were 98.6%, 95.0%, 98.3%, 92.1% and 89.1%, respectively. A moderate/strong correlation was observed between the experimental in vivo and predicted in vitro values for the external set chemicals, except fathead minnow. The generated QSTR models may provide an initial, rapid screening and prioritization of these diverse chemicals for the acute fish toxicity assessment and reduce the need for extensive in vivo toxicity testing.