Crohn hastalığında vitamin D reseptörü ve interlökin gen ailesi tek nükleotit polimorfizmlerinin belirlenmesi

Abstract

Crohn hastalığı, öncelikle sindirim sistemini etkileyen, karmaşık, uzun süreli,kronik bir bağırsak hastalığıdır. Aşırı iltihaplanmaya neden olan anormal bağışıklıkyanıtları içerir. İnflamasyon sindirim sisteminin herhangi bir yerinde, ağızdan anüsekadar meydana gelebilir. En çok bağırsak duvarlarını, özellikle ince bağırsağın altkısımlarını ve kalın bağırsağı etkiler. İnflamasyon olduğu zaman iltihaplı dokularkalınlaşır şişer, sindirim sisteminin iç yüzeyinde açık yara gibi ülserler oluşur.Crohn hastalığının nedeni tam olarak bilinmemektedir. Çevresel faktörler, genetikyatkınlık, immünolojik yetersizlik gibi sebepleri olabilir. Crohn hastalığına bağlıgenlerin çoğu bağışıklık sistemi fonksiyonunda rol oynar. Crohn hastalarındagörülen düşük Vitamin D düzeyleri dikkati çekmektedir. Bu amaçla VDR genindegörülen polimorfizmlerinflamatuar bağırsak hastalığı olan kişilerde araştırılmış veVDR polimorfizmleri ile tez kapsamında Crohn ve ülseratif kolit hastalarındakiilişki değerlendirilmiştir. Ayrıca interlökinlerde görülen düzensizliğintanımlanabilmesine yönelik olarak polimorfizmler sağlıklı kontroller, Crohnhastalığı ve ülseratif kolit hastalarından elde edilen periferik kan örneklerinden eldeedilen DNA örneklerinde incelenmiştir.Kontrol ve Crohn hastalarında ILRN'deki polimorfizmleri ve allelleri açısındanistatiksel olarak farklılık bulunmamıştır. Sağlıklı kontrol, ülseratif kolit ve Crohnhastalarında allel sıklıkları hesaplanmıştır.VDR genindeki polimorfizmlerin belirlenmesinde FokI ile kesim yapılan ürünleriçin Crohn hastalığına duyarlılığı, TaqI ile kesim yapıldığında ise ülserleşmiş kolitekarşı duyarlı olduğu yapılan analizler sonucu görülmektedir.IL-8 (845) rs2227532 ve IL-8 (-251) rs4073 polimorfizmi kontrol ve hasta gruplarıarasında anlamlı bir fark bulunamamıştır.Tez kapsamında İBH'lerde VDR ve interlökinpolimorfizmlerinin çalışılmasınadikkat çekilmiş olup, gerekli teknik süreç tanımlanabilmiştir. Ancak gelecekçalışmalarda daha fazla hasta grubunun çalışmaya alınması istatistiksel olarakyeterli sayıda verinin eldesine olanak sağlayacaktır.

Crohn's disease is a complex, long-term, chronic bowel disease that primarilyaffects the digestive system. It contains abnormal immune responses that causeexcessive inflammation. Inflammation can occur anywhere in the digestive tract,from the mouth to the anus. It affects mostly the intestinal walls, especially thelower parts of the small intestine and the large intestine. When inflammationoccurs, the inflamed tissues become thick, swollen, ulcers such as open woundsoccur on the inner surface of the digestive tract. The etiology of Crohn's disease isunknown. Environmental factors, genetic predisposition, immunological deficiencyare the most probably underlying reasons. The genes that are linked to Crohn'sdisease play a role in immune system function. Low vitamin D levels seen inCrohn's patients are noteworthy. For this purpose, polymorphisms in vitamin Dreceptor (VDR) gene were investigated in patients with inflammatory bowel diseaseand the relationship between VDR polymorphisms and Crohn's and ulcerativecolitis patients were evaluated. In addition, polymorphisms were examined in DNAsamples obtained from peripheral blood samples obtained from healthy controls,Crohn's disease and ulcerative colitis patients in order to identify the disorder seenin interleukins. There was no statistically significant difference in ILRN and allelesin control and Crohn's patients. Allele frequency was calculated in healthy control,ulcerative colitis and Crohn's patients. In the determination of polymorphisms inthe VDR gene, sensitivity to Crohn's disease for FokI-cut products and sensitivityto ulcerated colitis when cut with TaqI is observed.The IL-8 (845) rs2227532 and IL-8 (-251) rs4073 polymorphism did not show asignificant difference between the control and patient groups.Within the scope of the thesis, attention was drawn to the study of VDR andinterleukinpolymorphisms in IBDs and necessary technical process could bedefined. However, recruitment of more patient groups in the future studies willallow obtaining sufficient statistical data.