Şanliurfa i̇li̇nde görülen e.granulosus suşlarinin PCR-RFLP yöntemi̇ i̇le genoti̇plendi̇ri̇lmesi̇

Abstract

Echinococcus granulosus larvalarının neden olduğu kistik ekinokokozis hem insanlarıhem de hayvanları etkileyen dünyadaki en önemli zoonozlardan birisidir. Parazitin erginşekilleri köpek, kurt, çakal ve diğer kanidelerin ince bağırsaklarında, larva formu ise koyun,keçi, sığır, domuz, insan ve birçok memeli hayvanın iç organlarında bulunmaktadır.Günümüzde Türkiye'de Echinocuccus granulsus'un suşları hakkında detaylı bilgibulunmamaktadır. Bu amaçla Türkiye'nin Şanlıurfa ilindeki hastane ve mezbahaneden 33insan ve 80 koyun olmak üzere toplam 113 hidatik kist izolatı toplanmıştır. Bu izolatlarıngenetiğini belirlemek amacıyla örneklerin ribozomal DNA internal transcribed spacer gene 1(rDNA-ITS1) bölgesi PCR-RFLP tekniğiyle incelenmiştir.Aynı band profiline sahip olması sonucu izolatların hepsinin yaygın koyun suşu (G1)olduğu belirlenmiştir. Mevcut çalışma Türkiye'nin Şanlıurfa ilimizin E. granulosus 'un evcilkoyun suşunun baskın genotip olduğunu göstermektedir. Yapılan çalışma bu bölgede koyunsuşunun bulunduğunu gösteren rapordur. Bu bilgi bu bölge ve çevre ülkelerde hayvanlardakiparazitlerin epidemiyolojisi ve ekolojisi ile ilgili ileri çalışmalar açısından oldukça önemlidir.

Cystic echinococcosis caused by larvae of the Echinococcus granulosus is affectingboth people and animals and it is one of the world's most important zoonosis. The adult formsof parasite are found dogs, wolves, jackals and other canids small intestine and the larvaeforms are found sheep, goats, cattle, pigs, humans and many other mammals internal organs.There is still no detailed molecular data about the strains of Echinococcus granulosusin Turkey.For this aim 113 hydatid cyst isolates contained 33 human and 80 sheep werecollected from Şanlıurfa provinces in the regions of Turkey. In order to determine geneticvariatin, ribosomal ITS-1(lnternal Transcribed Spacer )gen regions of isolates were analysedby PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction - Restriction Fragment Length Polymorphism).The result of this study analysed isolates were belonging to the common sheep strain (G1).The present study revealed that domestic sheep strain is the most common genotype inŞanlıurfa provinces of Turkey. This is the report indicating that E. granulosus sheep strain ispresent in human in this region. This knowledge is quite important for future studies on theepidemiology and ecology of the parasites in animals and humans in this region andsurrounding countries.