Diyarbakır yöresi kıl keçilerinin moleküler filogenetik analizi

Abstract

Bu çalışmada, Diyarbakır yöresindeki Kıl keçilerinin filogenetik yapıları moleküler tekniklerle belirlenmeye çalışılmıştır. Araştırmanın hayvan materyalini, Diyarbakır yöresinde yetiştirilen Kıl keçileri oluşturmuştur. Kıl keçilerinde D-loop bölgesi dizisine göre; toplam bölge sayısı, G+C oranı, polimorfik bölge sayısı, haplotip sayısı, haplotip farklılığı ve nükleotid farklılığı değerleri sırasıyla, 481, 0.378, 37, 20, 1.000±0.0016, ve 0.01601±0.00006 olarak bulunmuştur. Kıl keçisi haplotipleri arasında genetik uzaklıklar 0.002-0.034 arasında hesaplanmıştır. Bu çalışmadaki keçi haplotiplerin Dloop dizileri ve referans dizi (A, B, C, D, F ve G soyları için) ile birlikte oluşturulan Neighbor-Joining (N-J) filogenetik ağaçta, 20 haplotip A soyunda yer almıştır.

In this research, determination of phylogenetic tree of goats in Diyarbakır province using molecular techniques was the main goal. Hair goats raised in Diyarbakır province were used as the animal materials. In Hair goats, base on D-loop sequence; the number of DNA sequence, G + C ratio, polymorphic region number, the number of haplotypes, haplotype diversity and nucleotide diversity were calculated as 481, 0.378, 37, 20, 1.000±0.016, and 0.01601±0.00006, respectively. The genetic distance was calculated as 0.002-0.034 between haplotypes. Neighbor-Joining (N-J) phylogenetic tree formed in this research using goat haplotype D-loop sequences and reference sequences (for A, B, C, D, F and G lineages), 20 haplotypes were in A lineage.