İdiyopatik pulmoner fibrozis (IPF) ve platelet kökenli büyüme faktörü reseptörü β (PDGFR-β) polimorfizmleri, arasındaki ilişki

Abstract

İdiyopatik pulmoner fibrozis (İPF) nedeni bilinmeyen kötü prognoz ile karakterize olan kronik ve ilerleyici bir interstisyel akciğer hastalığıdır. İPF değişik klinik fenotiplerde ortaya çıkan heterojen bir hastalık olup, çeşitli risk faktörleri vekomorbiditelerden etkilenmektedir. İPF'in 5 yıllık sağkalım oranı %20'dir ve erkeklerde daha fazlagörülmektedir. Ülkemizde İPF görülme sıklığı az olup, bu oran 5/100.000 olarak bildirilmiştir. Plateletkökenli büyüme faktörleri (PDGF) kan damarı oluşumunda rol oynayan büyüme faktörleridir. PDGF'lerakciğer fibroblastlarının büyümesini ve göçünü uyararak pulmoner fibroziste önemli rol oynar. PDGFreseptörü-β (PDGFR-β) tümör mikroçevresinde artan bir reseptör tirozin kinazdır. PDGFR'lerinin inhibeedilmesinin İPF ilerlemesini yavaşlatabileceği bildirilmiştir. Bununla birlikte İPF ve PDGFR-βpolimorfizmleri arasındaki ilişkiyi gösteren bir çalışmaya rastlanılmamıştır. Çalışmamızın amacı,Türkiye'nin Doğu Anadolu Bölgesi popülasyonunda İPF hastalarında PDGFR-β polimorfizmlerinin(rs246395, rs3828610, rs138008832, rs2302273) allel ve genotip frekanslarını belirlemek ve bupolimorfizmlerin İPF hastalığı yatkınlığı ile ilişkisini tanımlamaktır. Bu çalışma 2020-2021 yıllarıarasında 11 İPF hastası ve 12 kontrol grubundan toplanan kan örnekleri üzerinde gerçekleştirilmiştir. Kanörneklerinden izole edilen DNA'dan Gerçek Zamanlı PZR (qPZR) kullanılarak Taqman yöntemi ilegenotipleme yapılmıştır. Hasta ve kontrol grubu arasında PDGFR-β polimorfizmleri allel ve genotipfrekansları (rs3828610 hariç) ve klinik/demografik özellikler istatistiksel olarak anlamlı değildi (p>0.05).rs3828610 için hasta ve kontroller arasında A alleli taşımayanlar (CC) A-alleli taşıyanlara göre anlamlışekilde yüksekti (p=0.03). Sonuç olarak rs3828610 CC genotipi İPF için bir risk faktörü olabilir, ancakPDGFR-β polimorfizmlerinin hastalığa yatkınlığının belirlenebilmesi için daha fazla çalışmaya ihtiyaçvardır

Idiopathic pulmonary fibrosis (İPF) is a chronic and progressive interstitial lung disease characterized by a poor prognosis of unknown cause. İPF is a heterogeneous disease which occurs in different clinical phenotypes and is influenced by differentrisk factors and comorbidities. The 5-year survival rate of İPF is 20%, and it is more common in men.The incidence of İPF is low in our country, and this rate has been reported as 5/100,000. Platelet-derivedgrowth factors (PDGF) are growth factors that play a role in blood vessel formation. PDGFs play animportant role in pulmonary fibrosis by stimulating the growth and migration of lung fibroblasts. PDGFreceptor-β (PDGFR-β) is a receptor tyrosine kinase that is increased in the tumor microenvironment. Ithas been reported that inhibiting PDGFRs may slow the progression of IPF. However, no study wasfound showing the relationship between İPF and PDGFR-β polymorphisms. The aim of our study is todetermine the allele and genotype frequencies of PDGFR-β polymorphisms (rs246395, rs3828610,rs138008832, rs2302273) in İPF patients in the Eastern Anatolian Region of Turkey population and todescribe the relationship of these polymorphisms with İPF disease susceptibility. This study was carriedout on blood samples collected from 11 İPF patients and 12 control groups between 2020-2021.Genotyping was performed by Taqman method using Real Time PCR (qPCR) from DNA isolated fromblood samples. Allele and genotype frequencies (except rs3828610) and clinical/demographiccharacteristics were not statistically significant between the patient and control groups for all PDGFR-βpolymorphisms (p>0.05). rs3828610 A allele-non carriers (CC) compared the A allele-carriers weresignificantly higher in patients than in controls (p=0.03). In conclusion, rs3828610 CC genotype may be arisk factor for İPF, but more studies are needed to determine the disease susceptibility of PDGFR-βpolymorphisms.