Show simple item record

dc.contributor.advisorKaya Demir, Zehra
dc.contributor.authorŞahin, Elif Sena
dc.date.accessioned2023-09-22T11:49:35Z
dc.date.available2023-09-22T11:49:35Z
dc.date.submitted2023-03-27
dc.date.issued2021
dc.identifier.urihttps://acikbilim.yok.gov.tr/handle/20.500.12812/736458
dc.description.abstractMide kanseri, Dünya genelinde ve Türkiye'nin özellikle Doğu Anadolu Bölgesi ve çevresinde yüksek insidans ve mortalite oranlarına sahiptir. Mide kanseri, genetik ve epigenetik varyantlarla ilişkilidir ve kanser prognozunu iyileştirmek için terapötik hedefler tanımlanmalıdır. Epigenetik düzenlemelerden biri olan DNA metilasyonu, mide tümörlerinde mutasyonlardan daha sık meydana gelmektedir ve bu nedenle böyle hastalıkların saptanmasında DNA metilasyonunun daha spesifik bir test olabileceği düşünülmektedir. En korunmuş üyesi insülin benzeri büyüme faktörü bağlayıcı protein-5 (IGFBP5) olan IGFBP'lerin kanserlerdeki rolü üzerine zıt sonuçlar bulunmaktadır. Ayrıca IGFBP5'in mide kanserinde sadece ekspresyonu ile ilgili çalışmalar olup, metilasyonu ilk defa bu çalışma ile incelenmiştir. Çalışmamızın amacı, mide kanserinde IGFBP5'in metilasyonu ve ekspresyonu arasındaki ilişkiyi inceleyerek, mide kanseri ve klinik parametrelerle ilişkisini belirlemektir. Bu çalışma, 2019-2021 yılları arasında, 100 mide kanserli hasta ve 100 sağlıklı kontrol grubu üzerinde gerçekleştirilmiştir. IGFBP5 geni promotor metilasyon durumu metilasyon spesifik PZR (MSP) yöntemiyle, mRNA ekspresyonu ise gerçek zamanlı/ kantitatif ters transkripsiyon PZR (RT-qPZR) ile gerçekleştirilmiştir. Sigara kullanımı, sıcak çay tüketimi, reflü ve Van otlu peynir tüketimi ve mide kanseri anlamlı şekilde ilişkiliydi (p<0,05). Hastalarda klinik veriler ve diğer çevresel etmenler, IGFBP5 geni metilasyonu ve ekspresyonu ile ilişkili değildi (p>0,05). IGFBP5 geni promotor metilasyonu hastalarda kontrollere göre anlamlı olarak daha düşüktü (p=0,04). Aynı şekilde IGFBP5 geni mRNA ekspresyonu da hastalarda kontrollere göre anlamlı şekilde daha düşüktü (p<0,0001). Ancak IGFBP5 metilasyonu ve ekspresyonu arasında anlamlı bir ilişki yoktu (p>0.05). Sonuç olarak, IGFBP5 metilasyonu ve ekspresyonu ayrı ayrı mide kanseri ile ilişkili olabilir, ancak metilasyonunun ekspresyonla ilişkisinin netleşmesi için daha fazla çalışmaya ihtiyaç vardır.
dc.description.abstractGastric cancer (GC) has a high incidence and mortality rate worldwide, including in Turkey, particularly in the Eastern Anatolia Region and its environs. GC is associated with genetic and epigenetic variants, and therapeutic targets must be identified to improve cancer prognosis. One of the epigenetic rearrangements, DNA-methylation, occurs more commonly than mutations in GCs, which has made DNA-methylation a more specific test for the detection of such diseases. There are conflicting results on the role of IGFBPs in cancers, the most conserved member of which is insulin-like growth factor-binding protein-5 (IGFBP5). Furthermore, there have only been studies on IGFBP5 expression in gastric cancer, and its methylation was investigated for the first time in this study.The purpose of this study is to investigate the relationship between IGFBP5 methylation and expression in GC, as well as its relationship to GC and clinical parameters. This study was carried out on 100 GC patients and 100 healthy control groups between 2019-2021. IGFBP5 gene promoter methylation status was determined by methylation-specific PCR (MSP) method, and mRNA expression was determined by real-time/quantitative reverse transcription PCR (RT-qPCR). Smoking, hot tea consumption, reflux and Van-herbed cheese consumption were found to be significantly associated in patients with GC (p<0.05). Clinical data and other environmental factors in patients with GC were not associated with IGFBP5 gene methylation and expression (p>0.05). IGFBP5 gene promoter methylation is significantly lower in individuals with cancer compared to controls (p=0.04). Likewise, IGFBP5 gene mRNA expression was also found to be significantly lower in patients than controls (p<0.0001). However, there was no significant relationship between IGFBP5 methylation and expression. As a result, IGFBP5 methylation and expression may be separately associated with GC, but further studies are needed to clarify the relationship of methylation to expression.en_US
dc.languageTurkish
dc.language.isotr
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rightsAttribution 4.0 United Statestr_TR
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.subjectTıbbi Biyolojitr_TR
dc.subjectMedical Biologyen_US
dc.titleMide kanseri ve insülin benzeri büyüme faktörü bağlayıcı protein-5 (IGFBPp5) metilasyonu arasındaki ilişki
dc.title.alternativeRelationship between gastric cancer and insulin-like growth factor binding protein-5 (IGFBP5) methylation
dc.typemasterThesis
dc.date.updated2023-03-27
dc.contributor.departmentTemel Tıp Bilimleri Ana Bilim Dalı
dc.subject.ytmExpression
dc.subject.ytmGene expression
dc.subject.ytmMethylation
dc.subject.ytmStomach diseases
dc.subject.ytmStomach neoplasms
dc.subject.ytmMicro RNA
dc.subject.ytmNeoplasms
dc.subject.ytmDNA methylation
dc.subject.ytmInsulin like growth factor 5
dc.identifier.yokid10307194
dc.publisher.instituteSağlık Bilimleri Enstitüsü
dc.publisher.universityVAN YÜZÜNCÜ YIL ÜNİVERSİTESİ
dc.identifier.thesisid705161
dc.description.pages81
dc.publisher.disciplineTıbbi Biyoloji Bilim Dalı


Files in this item

FilesSizeFormatView

There are no files associated with this item.

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

info:eu-repo/semantics/openAccess
Except where otherwise noted, this item's license is described as info:eu-repo/semantics/openAccess