Marmara bölgesinde yetiştirilen bazı zeytin (Olea europaea L.) kültivarlarının moleküler sistematik analizi

Abstract

Yapılan incelemeler sonucu PCR (Polymerase Chain Reaction)'a dayalı DNAmarkırların günümüzde ön plana çıkmıs oldukları, bunlardan da RAPD (RandomAmplified Polymorphic DNA) polimorfizm belirleme yaklasımının bugün en çokkullanılan yöntemler arasında yer aldıgını görüldü. RAPD markırlar taksonomiksınıflandırmada, sistematik iliskilerin belirlenmesinde ve populasyon genetigiçalısmalarında, kullanılabilmektedirBu çalısmada, Marmara Bölgesinde yetistirilen bazı zeytin(Olea europaea L.) kültivarlarının DNA markırları kullanılarak molekülersistematiginin yapılması hedeflenmistir. Bu amaçla, RAPD-PCR teknigi kullanılarakkültivarlar arasında genetik benzerlik ya da farklılıkların belirlenmesine çalısılmıstır.RAPD-PCR sonuçlarına göre; kullanılan 10 baz uzunlugunda 7 farklı primeramplifikasyon göstermis ve çalısılan 12 kültivar arasında % 46,42 oranındapolimorfizm elde edilmistir. Primerlerden toplam 84 karakter elde edilmis ve bukarakterlerin 39 tanesi polimorfik bulunmustur. PAUP* (Phylogenetic AnalysisUsing Parsimony and Other Methods) filogenetik analiz programı kullanılarakkültivarlar arasındaki akrabalık iliskileri ve genetik uzaklıkları belirlenmistir. PAUPverilerine göre birbirine en yakın genetik uzaklık 0,03571 ile Gordal ve Karamürselsu kültivarları arasında iken, en uzak genetik uzaklık 0,17857 ile Arbequina ileAscolana, Manzanilla hermandos, Gemlik, Verdial ve Vegral kültivarları arasındatespit edilmistir.Anahtar sözcükler: Zeytin (Olea europaea L.), RAPD-PCR, Filogenetik Analiz,PAUP*.

Based on our literature research, it is noticed that DNA markers based onPCR (Polymerase Chain Reaction) techniques are widely used in recent days.Depending on our observation, RAPD (Randomly Amplified Polymorphic DNA)was found one of the most commonly used applications for determining thepolymorphisms. RAPD markers can be used in population genetics studies, insystematic analyses, and in taxonomic classification studies.In this research, it is intended to perform a molecular systematic analysis usingDNA markers for some olive cultivars (Olea europaea L.) grown in the MarmaraRegion. Thus using RAPD-PCR techniques, it was attempted to determine thegenetic relationships, including similarities and differences, among the ingroup taxa.Based on the RAPD-PCR techniques; seven different primers with 10 base-pairlong sequence showed amplification and 46.42 % polymorphism was found betweenthe studied 12 cultivars. 84 characters were derived from the primers in total and 39of these were found to be polymorphic. Relationships and genetic distances betweenthe cultivars were calculated by using the PAUP* (Phylogenetic Analysis UsingParsimony and Other Methods phylogenetic) analysis program. Based on the PAUPanalyses, the closest genetic distance was found between Gordal and Karamursel sucultivars as 0.03571 whereas the most distant values were found between Arbequinaand, respectively, Ascolana, Manzanilla hermandos, Gemlik, Verdial, and Vegralcultivars.Key words: Olive (Olea europaea L.), RAPD-PCR, Phylogenetic Analysis, PAUP*.