İshalli sığırlarda eschericiıa fergusonii varlığının ve antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi

Abstract

Araştırmamızda E. fergusonii etkenlerinin, yetiştiriciliği yapılan sığır populasyonlarında fenotipikve genotipik olarak belirlenmesi ve antibiyotik duyarlılıklarının saptanması amaçlanmıştır.Araştırma materyalini oluşturan hayvanlar sığır yetiştiriciliği yapılan çiftliklerden temin edilmiş,toplam 100 adet ishal şikayeti olan hayvandan rektal svap alınmıştır. Alınan svaplar, soğuk zincirdevakit kaybetmeden Adnan Menderes Üniversitesi Veteriner Fakültesi Mikrobiyoloji AnabilimDalına getirildikten sonra 5 ml Tryptic Soy Broth (TSB) içeren tüplerde 37°C'de 24 saat inkubeedilmiştir. TSB'de yapılan ön inkubasyondan sonra her bir sıvı besiyerinden bir öze dolususüspansiyon alınarak % 4 adonitol ilaveli Simmon Citrate Agara ekimi yapılmış, 37°C'de 24 saatinkube edilmiştir. Üreme gözlenen kolonilerden adonitol pozitif olan koyu sarı ve turuncu kolonilerseçilerek Sorbitol-MacConkey agara ekim yapılmıştır. 37°C'de 24 saat inkube edilen SMAC agardasorbitol fermente etmeyen şeffaf Gram negatif küçük kokobasil koloniler seçilerek saflaştırıldıktansonra biyokimyasal özeliklerinin belirlenmesi için API 20E test kiti ile değerlendirilmiştir. API testisonucunda toplam 49 adet E. coli izole ve identifiye edilmiştir. API 20E identifikasyon testlerisonucu E. coli olarak adlandırılan izolatların kontrol geni olan E. coli uidA ile moleküler olarakdoğrulanmış, ayrıca Efer 13 e Efer YP primerleri ile yapılan moleküler identifikasyon sonucunda,çoklu ilaca dirençli E. fergusonii suşlarının bulunduğu ve bu suşların da uidA geni taşıdığı tespitedilmiştir. API 20E identifikasyon testleri sonucu E. coli olarak adlandırılan izolatların kontrol geniolan E. coli uidA ile moleküler olarak doğrulanmış, ayrıca Efer 13 e Efer YP primerleri ile yapılanmoleküler identifikasyon sonucunda, çoklu ilaca dirençli E. fergusonii suşlarının bulunduğu ve busuşların da uidA geni taşıdığı tespit edilmiştir. Antibiyogram testi sonucunda Saha suşlarına karşıkullanılabilecek etkili antibiyotikler olarak Amoksisilin-Klavulanik Oksitetrasiklin, Florfenikol veSefaperazon belirlenmiştir.

In our study, it was aimed to determine phenotypic and genotypic determinants of E. fergusoniiagents in cattle populations cultivated and to determine antibiotic susceptibilities. Animals thatconstitute the research material were obtained from cattle breeding farms and a total of 100 rectalswabs were collected from animals with diarrhea complaints. The swabs were incubated at 37 ° Cfor 24 hours in tubes containing 5 ml of Tryptic Soy Broth (TSB) after being brought to the AdnanMenderes University Veterinary Faculty Department of Microbiology without delay in the coldchain. After preincubation in TSB, a whole volume of suspension from each liquid medium willsuspended and Simon Citrate Agar supplemented with 4% adonitol will incubated for 24 hours at37 ° C. Sorbitol MacConkey agar was inoculated by choosing dark yellow and orange colonieswhich were adonitol positive from the breeding observed colonies. Transparent Gram negativesmall cocobacillus colonies that did not ferment sorbitol to SMAC agar which was incubated at 37 °C for 24 hours and tested by API 20E test kit to determine their biochemical properties. A total of49 E. coli isolates were identified and identified as a result of the API test. As a result of themolecular identification of the isolates named as E. coli uidA, which is the result of theidentification tests of the API 20E, and the molecular identification with Efer 13 e Efer YP primers,it was found that there were multiple strains of E. fergusonii strains and these strains were alsoidentified as uidA gene have been identified. As a result of the molecular identification of theisolates identified as E. coli uidA, which is the result of the identification tests of the API 20E, andthe molecular identification with Efer 13 e Efer YP primers, it was found that there were multiplestrains of E. fergusonii strains and these strains were also identified as uidA gene have beenidentified. As a result of the antibiogram test, Amoxicillin-Clavulanic Oxytetracycline, Florfenicoland Cefoperazone were determined as effective antibiotics against field strains.