Kendilenmiş cin mısır hatlarının morfolojik ve moleküler karakterizasyonu

Abstract

Bu çalışmada, 35 adet durulmuş cin mısır hattının genetik ilişkileri 34 adet morfolojik özellik ve 21 adet SSR primeri kullanılarak incelenmiştir. Çalışma 2014 yılında Batı Akdeniz Tarımsal Araştırma Enstitüsü'nde yürütülmüştür. Morfolojik özelliklerin gözlemlendiği hatlar tesadüf blokları deneme desenine göre 3 tekerrürlü olarak yetiştirilmiştir. Onüç adet kalitatif özellik bakımından varyans analizine tabi tutulan hatlar birbirlerinden istatistiki olarak % 1 düzeyinde farklı bulunmuştur. Moleküler çalışmada kullanılan 21 adet SSR primerinden 13 adedi (Mmc 0501, Bnlg 149, bnlg 1176, Phi 053, Phi 085, Umc 1035, Umc 1241, Umc 1636, Umc 1736, Umc 2245, Umc 2255 ve Umc 2262) polimorfik bulunmuştur. Çalışmada toplam 41 adet allel üretilmiş ve ortalama lokus başına 1.95 allel saptanmıştır. Primerlerde yaklaşık allel uzunlukları 100 ile 210 bç arasında ve PIC değerleri 0.00 ile 0.55 arasında değişmiştir. Morfolojik ve moleküler veriler kullanılarak hatların birbirlerine olan genetik uzaklıkları hesaplanmış ve dendogramları çıkartılmıştır. Morfolojik gözlem verilerine göre oluşturulan dendogramda hatlar 2 temel ve 4 ana kümeye ayrılarak, 0.31 ile 0.88 aralığında benzerlik gösterirken, moleküler veriler ile oluşturulan dendogramda hatlar 2 temel ve 5 ana kümeye dağılmış ve 0.44 ile 0.95 aralığında benzerlik göstermişlerdir. Her iki dendogram birlikte değerlendirildiğinde, genetik uzaklık bakımından dendogramlar arasında tam bir bağlantı tespit edilememiştir. Bu nedenle bu çalışmada kullanılan cin mısır materyali için morfolojik ve moleküler verilerin birlikte değerlendirilmesi gerektiği sonucuna varılmıştır.

In this study, genetic distances of 35 popcorn inbred lines were investigated by 34 morphological traits and 21 SSR primers. The study was carried out at Bati Akdeniz Agricultural Research Institute in 2014. The experiment was conducted according to randomised complete block design with three replications. Variance analysis based on 13 qualitative traits showed that popcorn inbred lines were statistically (P<0.01) different from each other. 13 SSR primers (Mmc 0501, Bnlg 149, bnlg 1176, Phi 053, Phi 085, Umc 1035, Umc 1241, Umc 1636, Umc 1736, Umc 2245, Umc 2255 ve Umc 2262) of 21 primers used in the study were found to be polymorphic. In the study, 41 alleles were generated and a mean of 1.95 alleles per locus was determined. Approximate allele length in primers changed between 100bp and 210pb. PIC values varied between 0.00 and 0.55. Genetic distances of the popcorn inbred lines were determined and dendrograms were formed. Dendrogram generated from the morphological traits revealed 2 main and 4 sub-clusters and the similarity coefficient between lines was 0.31 and 0.88. On the other hand, 2 main and 5 sub-clusters were formed based on SSR analysis. The similarity interval of the molecular analysis was 0.44 and 0.95. When both dendrograms were considered together, a complete connection between dendograms in terms of genetic distances could not determined. Therefore, it was concluded that morphological and molecular data should be evaluated together for popcorn material used in this study.