T Hücreli Non-Hodgkin Lenfomalarda MikroRNA İfade Profillendirmesi ve AyırıcıTanıdaki Önemi

Abstract

T/NK hücreli non-Hodgkin lenfomalar (T/NKHNHL) patogenezleri ile ilgili sınırlı bilgi, ayırıcıtanıları ve tedavi başarılarında güçlükler bulunduran neoplazilerdir. MikroRNA'lar (miRNA) genifadelerini `post-transkripsiyonel` olarak regüle eden ve lenfoma dahil çoğu neoplazide anormalolarak ifade olan küçük RNA'lardır. Ayırıcı tanı ve hedefe yönelik tedaviler için önemli adaymoleküllerdir. T/NKHNHL'lerda miRNA ifade profili ve patogenezdeki rolleri hakkında sınırlıbilgi bulunmaktadır. Bu çalışmada, birbiriyle ayırım güçlüğü bulunduran Anjioimmünoblastik Thücreli lenfomalar (AİTHL), CD30+ ve CD30- Periferik T hücreli lenfoma-NOS (PTHL-NOS) vereaktif hiperplazi olgularının miRNA ifade profilli belirlenmesi amaçlanmıştır. Bu amaçla, AnkaraÜniversitesi Tıp Fakültesi (AÜTF) Tıbbi Patoloji Anabilim Dalı'nda 2006-2013 yılları arasındaCD30-/CD30+ PTHL-NOS, AİTHL ve benign reaktif hiperplazi tanısı almış olgular Dünya SağlıkÖrgütü (WHO) kriterlerine göre iki patolog (GK ve IK) tarafından yeniden değerlendirilmiştir.Çalışmamızda, 6 CD30-, 6 CD30+ olmak üzere toplamda 12 PTHL-NOS ve 8 AİTHL ile 10 reaktifhiperplazi formalin tespitli parafine gömülü (FTPG) lenf nodu örneklerinde mikrodizin analizigerçekleştirilmiştir. Nodal tip T/NK hücreli lenfomalar ile reaktif hiperplazi olguları arasında 62miRNA'nın farklı şekilde ifade olduğu ve bunların çoğunluğunun T/NK hücreli lenfomalardaifadesinin azaldığı belirlenmiştir (MannWhitneyU, p<0.001). hsa-miR-4746-3p'nin en fazla artış,hsa-miR-144-3p'nin ise en fazla azalış gösteren miRNA'lar olduğu bulunmuştur. Hasta altgruplarından AİTHL ile CD30- PTHL-NOS arasında 1, AİTHL ile CD30+ PTHL-NOS arasında 7,CD30- PTHL-NOS ile CD30+ PTHL-NOS arasında 12 miRNA'nın farklı olarak ifade olduklarıgörülmüştür (Kruskal Wallis, p<0.05). AİTHL ile CD30+ PTHL-NOS arasında en fazla farklılıkgösteren miRNA hsa-miR-99b-5p, AİTHL ile CD30- PTHL-NOS arasında hsa-miR-222-3p,CD30- ile CD30+ PTHL-NOS arasında hsa-miR-221-3p dır. Farklı şekilde ifade olduğu belirlenen9 miRNA'nın 5'i QRT-PZR analizi ile doğrulanmıştır. Bu çalışma ile AİTHL, CD30+ ile CD30-PTHL-NOS hasta altgrupları ve reaktif hiperplazi örneklerinin birbirlerinden farklı miRNAifadeleri sergiledikleri gösterilmiştir. Bunlar lenfoma antitelerinin gelişim biyolojisininaçıklanmasında kullanılabilecek aday belirteçler olabilirler.

T/NK cell non-Hodgkin lymphomas (T/NKCNHL) are mature T cell neoplasia, which have notbeen very well understood with their pathogenesis. There are difficulties on their differentialdiagnosis and poor success on therapy. MicroRNA's (miRNA) are group of non cooding RNAmolecules regulating gene expression at postranscriptional level. These small RNA molecules areusually abnormally expressed in various neoplasia including lymphomas. They are importantcandidate molecules to solve the problem of differential diagnosis between T cell lymphomasubgroups, as well as promising therapy targets. The miRNA expression profile of T/NKCNHL isnot very well documented. In this study our aim is to examine the miRNA profile ofAngioimmunoblastic T cell lymphomas (AITCL), CD30+ and CD30- Peripheral T cell lymphomasnot otherwise specified (PTCL-NOS) and compare with reactive lymphoid hyperplasia. In thisstudy T cell lymphomas diagnosed between 2006-2013 in the Department of Pathology School ofMedicine University of Ankara were reexamined by the two Pathologists (IK and GK) andclassified according to the 2008 WHO criteria. The formalin fixed parafine embeded lymph nodetissue samples were used for miRNA microarray analysis. Six cases of CD30+, 6 cases of CD30-PTCL-NOS, 8 AITCL and 10 reactive lymphoid hyperplasia were selected. There were 62miRNA's siginificantly different between PTCL and reactive hyperplasia, mostly presentingdownregulated expression (MannWhitneyU, p<0.001) in PTCL group. Hsa-miR-4746-3p was themost increased and hsa-miR-144- was the most decreased distingtive miRNA's in PTCL.Microarray results revealed 1 distingtive miRNA between AITCL and CD30- PTHL-NOS, 7miRNA's between AITCL and CD30+ PTHL-NOS, 12 miRNA's between CD30- PTHL-NOS andCD30+ PTHL-NOS (Kruskal Wallis, p<0.05). Hsa-miR-99b-5q in AITCL and CD30+ PTHLNOS,hsa-miR-222-3p in AITCL and CD30- PTHL-NOS, hsa-miR-221-3p in CD30- PTHL-NOSand CD30+ PTHL-NOS were the distingtive miRNA's. We confirmed the expression of the 5 of 9miRNA's by QRT-PZR. The result of this study revealed that, disease groups AITCL, CD30+PTHL-NOS, CD30- PTHL-NOS and the reactive lymphoid hyperplasia have different miRNAexpression which can be promising candidate markers for explaining the biology of the lymphomaentities.