Küçük hücreli olmayan akciğer kanserleriyle ilişkilendirilmiş tümör süpressör genlerin multıplex lıgatıon-dependent probe amplıfıcatıon (mlpa) yöntemi ile metilasyon paternlerinin incelenmesi

Abstract

Akcier kanseri, tüm dünyada mortalitesi en yüksek kanser türüdür vekardiyovasküler hastalıklardan sonra ölüm nedenleri arasında 2. sırada yer almaktadır.Metilasyon bir epigenetik mekanizma olup DNA düzeyinde herhangi bir mutasyonolmamasına ramen ilgili genin eksprese olmasını engelleyen bir molekülermekanizmadır.Çalımada henüz çok yeni bir yöntem olan Multiplex Ligation-dependent ProbeAmplification (MLPA) teknii ile akcier kanserleriyle daha önce ilikilendirilmi 24ayrı tümör süpressör genin promoter bölgelerinin metilasyon paternlerinin SALSA MSMLPAME001 tumorsuppressor probemix kiti kullanılarak incelenmesi amaçlanmıtır.Bu çalımaya stanbul Yedikule Göüs Hastalıkları Hastanesinde, histopatolojikolarak incelenerek ?küçük hücreli olmayan akcier kanseri? tanısı almı 100 olgu dahiledildi..Her hastaya ait doku örneklerinden kanser dokusu içeren 5 mikronluk kesitlerdenelde edilen DNA örnekleri çalıma grubu olarak, aynı hastaya ait kanser dokusuiçermeyen kesitlerden elde edilen DNA örnekleri de kontrol grubu olarak çalımayaalındı.Çalımada, akcier kanserli tümöral ve çevre akcier dokularında birbirlerineyakın oranlarda en sık CDKN2B, BRCA1, CDH13 ve HIC1 prob bölgelerindemetilasyon görüldü. Yine tümöral ve çevre dokularda PTEN, TIMP3, ATM, VHL,CD44, CDKN1B, RASSF1, IGSF4 ve ESR1 prob bölgelerinde de metilasyonsaptandı. APC, CDKN2A, MLH1, RARB, CHFR ve GSTP1 prob bölgelerinde farklıoranlarda, tümöral dokularda metilasyon görülürken, çevre akcier dokularında buprob bölgelerinde metilasyon saptanmadı.Sonuç olarak MS MLPA yönteminin akcier kanserlerinin metilasyon profillerinintaramasında kullanılabilecek, ucuz ve hızlı sonuç verebilen bir teknik olduugörülmütür. MS MLPA yönteminin dier metilasyon tarama yöntemleriylekarılatırılarak bir an önce senstivite ve spesivitesinin belirlenmesi ve akcierkanserinin erken tanısında rutin kullanıma geçirilmesi gerektiini düünmekteyiz.