Sendromik olmayan kraniyosinostozlu pediatrik olgularda olası aday genlerin tüm ekzom dizileme yöntemi ile incelenerek genotip – fenotip ilişkisinin değerlendirilmesi

Abstract

Amaç: Sendromik olmayan kraniyosinostoz, prematür sütür füzyonunun yol açtığıkonjenital bir malformasyondur. Projemizde, hedefli ekzom dizileme analizi kullanarak,sendromik olmayan kraniyosinostozun olası genotip-fenotip ilişkisinin aydınlatılmasıamaçlanmıştır.Yöntem: Sendromik olmayan kraniyosinostoz tanılı olgulardan, FGFR2 geni ekzon IIIave IIIc bölgelerinde mutasyon tespit edilememiş ve herhangi bir kromozomalabnormaliteye sahip olmayan 30 olgu çalışmaya dâhil edilmiştir. 21 olgu, 519 gen içerenaraştırma paneli kullanılarak hedefli yeni nesil dizileme analizine alınmış ve hastalıklailişkili olabilecek mutasyonlar saptanmaya çalışılmıştır. Diğer 9 olguya ise, 21 olgudatespit edilen olası patojenik mutasyonların bulunduğu ekzonlar için Sanger dizilemeanalizi yapılmıştır. Elde edilen moleküler genetik veri, olguların klinik verisi ilekarşılaştırılarak genotip-fenotip ilişkisi değerlendirilmiştir.Bulgular: Yapılan klinik değerlendirmeler sonucunda, olguların %37'sinde sagittalsinostoz, %33'ünde koronal sinostoz, %20'sinde metopik sinostoz ve %10'unda isemultisütür sinostozu tespit edilmiştir. Ayrıca, olguların %47'sinde en az bir okülerabnormalite tespit edilmiştir. DNA dizileme analizi sonucunda, olguların yaklaşık%20'sinde AXIN2, TCF12 ve ERF genlerine ait patolojik mutasyonlar tespit edilmiştir.TCF12 geninde p.M260fs*5 ve p.P369fs*26 mutasyonu taşıyan olguların bilateralkoronal sinostoza, AXIN2 geninde p.L349fs*24 mutasyonu taşıyan olgunun sagittalsinostoza ve ERF geninde p.G299fs*9 mutasyonu taşıyan olgunun ise sağ koronalsinostoza ve kapalı fontanellere sahip olduğu görülmüştür. Ayrıca, Sanger dizilemesonucunda brakisefalik olan bir olgunun TCF12 geninde c.825+5G>T splays bölgemutasyonu tespit edilmiştir.Sonuç: Sendromik olmayan kraniyosinostoz, hem genetik hem de fenotipik olarakoldukça heterojen bir anomalidir. Bulgularımız, sendromik olmayan kraniyosinostozluolgularda genetik tanının, kapanan sütürün çeşidine göre yapılmasının daha hızlı tanıyagötüreceği sonucunu ortaya koymaktadır.Anahtar Kelimeler: kraniyosinostoz, yeni nesil dizileme, moleküler genetik, sendromikolmayan kraniyosinostoz, genetik

Objective: Non-syndromic craniosynostosis is a congenital malformation caused by thepremature suture fusion. In this project, we aimed to brighten the genotype-phenotypecorrelations of the non-syndromic craniosynostosis by using targetted exomesequencing.Method: 30 non-syndromic cases with wild genotype for FGFR2 exon IIIa and IIIc, andnormal karyotype were included in the study. Twenty-one of the cases were sequencedby using next-generation targeted exome sequencing of the research panel including 519genes. The other nine of the cases were analyzed by using Sanger sequencing for theexons carried possibly pathogenic mutations which were identified in twenty-one of thecases. The obtained molecular genetic data were compared with the clinical data of thecases and the genotype-phenotype correlation was evaluated.Results: As a result of the clinical evaluation, 37% of the cases have sagittal synostosisand followed by coronal, metopic and multisuture synostosis with 33%, 20%, and 10%,respectively. Besides, it has been determined that 47% of the cases have at least oneocular abnormality. As a result of DNA sequencing, it has been detected that 20% of thecases have pathogenic mutations in AXIN2, TCF12 and ERF genes. It has been seen thatcases with p.M260fs*5 and p.P369fs*26 mutations in TCF12 gene have coronalsynostosis, the case with p.L349fs*24 mutation in AXIN2 gene has sagittal synostosisand the case with p.G299fs*9 mutation in ERF gene has unilateral coronal synostosisand closed fontanelles. In addition to these, by using Sanger sequencing, c.825+5G>Tsplice region mutation in TCF12 gene was detected in a case with brachycephaly.Conclusion: Non-syndromic craniosynostosis is both genotypically and phenotypicallyheterogeneous anomaly. Our findings revealed that screening of the genes depending onthe type of closed suture in non-syndromic craniosynostosis cases may lead to a fastergenetic diagnosis.Key words: craniosynostosis, next generation sequencing, molecular genetics, nonsyndromiccraniosynostosis, genetic