On ile otuzdokuz yaş arasında iki haftadan uzun süren öksürük şikayeti ile gelen hastalarda bordetella pertussis varlığının kültür ve pcr testleri ile araştırılması

Abstract

Boğmaca, B. pertussis'in neden olduğu, tüm yaş gruplarını etkileyebilen,bulaşıcı bir solunum yolu enfeksiyonudur. Özellikle yenidoğan ve bebeklerde yüksekmorbidite ve mortaliteye sahiptir. Adolesan ve erişkinlerde atipik seyreden hastalığaçoğu zaman tanı konulamamakta; bu hastalar duyarlı bebek ve çocuklara bulaştaönemli bir kaynak oluşturmaktadır. Bu nedenle iki haftadan uzun süren öksürüğüolan adolesan ve erişkinlerde B. pertussis enfeksiyonunun laboratuvar incelemeleriile araştırılması önerilmektedir.Bu çalışmada 2 hafta veya daha uzun süreli öksürüğü olan hastalarda B.pertussis sıklığını araştırmak amaçlanmıştır.10-39 yaş arası 2 hafta veya daha uzun süreli öksürüğü olan 214 hastaçalışmaya dahil edildi.Ekim 2010–Mayıs 2011 tarihleri arasında Akdeniz Üniversitesi HastanesiGöğüs Hastalıkları, Çocuk Hastalıkları ve Antalya Eğitim Araştırma HastanesiGöğüs Hastalıkları Polikliniklerinde hastalardan nazofarengeal sürüntü örneklerialındı. B. pertussis'in saptanmasında kültür ve PCR yöntemleri kullanılmıştır. B.pertussis'in PCR ile saptanmasında IS481 real time PCR, IS481 konvansiyonel PCRand ptxA-Pr gene PCR kullanılmıştır.Boğmaca tanısında real-time PCR ve konvansiyonel ptxA-Pr PCR testlerikullanılmış ve değerlendirme kriteri olarak eğer her iki PCR testi pozitif ise B.pertussis, IS481 pozitif ve Ct< 35 iken, ptxA-Pr PCR negatif ise Bordetella spp veIS481 PCR testi 35≤ CT≤40 ve ptxA-Pr PCR negatif ise belirsiz olarakdeğerlendirilmiştir.Hastaların üçünün kültüründe B. pertussis üredi. Toplam 51 örnek (%23) IS481real-time PCR yöntemiyle, 40 örnek (%18) IS481 konvansiyonel PCR yöntemiylepozitif olarak saptandı. 15 örnek konvansiyonel ptxA-PrPCR yöntemi ile pozitifbulundu. PCR sonuçları değerlendirme kriterlerine göre yorumlandığında 15 örnek B. pertussis, 11 örnek Bordetella spp., 25 örnek belirsiz, 163 örnek ise negatif olarakdeğerlendirildi.B. pertussis enfeksiyonu adolesan ve erişkinlerdeki persistan öksürüğün sıknedenlerinden biridir. PCR yönteminin kültür yöntemine göre duyarlılığının yüksekolması ve sonuç elde etme süresinin kısa olması gibi çeşitli avantajlarıbulunmaktadır. Ancak özgüllüğü ve çapraz reaksiyonların olması boğmaca tanısındatest sonuçlarının değerlendirilmesini güçleştirmektedir. Kültür ve PCR yöntemlerinintanı sürecinde önemli yerleri vardır ancak her iki yöntemin de kısıtlılıklarıbulunmaktadır. Tanı yöntemlerinin standize edilmesi gereklidir.

Pertussis or 'whooping cough' caused by B. pertussis, can affect all age groupsand is a contagious respiratory tract infection. It has significantly higher mortalityand morbidity especially among newborns and children. Adolescents and adults withatypical symptomatic pertussis are often the source of the organism for pediatriccases. Therefore, it is suggested to do laboratory diagnostic tests for B. pertussisinfection to the adolescents and adults with prolonged cough more than two weeks.The purpose of this study is to determine the frequency of the presence of B.pertussis among adolescent /adults who have prolonged cough for 2 weeks or longer.Two hundred and fourteen patients aged 10-39 years with the complaint ofcough persisting for 2 weeks or longer were enrolled in the study.Nasofarengeal swab specimens were obtained from patients in the Departmentsof Pediatrics and Pulmonary Medicine at the Akdeniz University Hospital and in theDepartment of Pulmonary Medicine at the Antalya Education and Research Hospitalbetween October 2010 and May 2011.Culture and PCR methods were performed to detect B. pertussis. IS481 realtime PCR, IS481 conventional PCR and ptxA-Pr gene PCR were used for PCRanalysis of B. pertussis.For the diagnosis of pertussis, IS481 real-time PCR and ptxA-Pr PCR wereused in combination and the interpretation criteria of PCR results were as follows: ifa specimen was positive for IS481 and ptxA-Pr it was considered to contain B.pertussis, if a specimen was positive for IS481 with a CT below 35 and negative forptxA-Pr it was considered to contain Bordetella spp, if a specimen was positive forIS481 with a CT between 35 and 40 and negative for ptxA-Pr, it was consideredindeterminate.Three patients were B. pertussis culture-positive. A total of 51 samples (23%)and 40 samples (18%) were positive B. pertussis PCR-positive by IS481 real-time PCR and IS481 conventional PCR, respectively. Fifteen samples were positive for B.pertussis by PCR method targeting ptxA-Pr gene. Using the interpretation criteria ofPCR results; 15 specimens were interpreted as positive for B. pertussis, 11 specimenswere interpreted as positive for Bordetella spp., 25 specimens were interpreted asindeterminate and 163 specimens were considered as negative.We conclude that B. pertussis infection is a common cause of persistant coughin adolescents and adults. PCR has several advantages over culture such as increasedsensitivity and decreased time of the results. However, there are potential problemsrelated to specificity and cross reactions that can complicate the interpretation of testresults for pertussis diagnosis. Culture and PCR continue to have prominent places inthe diagnostic process, but both have limitations. A standardisation of diagnosticmethods is needed.