Mikroskopik görüntüler üzerinde derin öğrenme algoritmaları kullanarak hastalıklı hücrelerin otomatik tanımlanması

Abstract

Eimeria parazit türlerini otomatik olarak algılamak ve hastalıklı olup olmadığını tespit etmek amacıyla, Çok Katmanlı Sinir Ağı ve Konvolüsyonel Sinir Ağı derin öğrenme algoritması kullanılarak bir model mimarisi geliştirilmiştir. Modele girdi olarak tavuk ve tavşanlara ait Eimeria mikroskobik görüntüleri kullanılmıştır.Görüntülerin işlenmesinde OpenCV kütüphanesi'nden faydalanılmıştır. Keras ve Theano kütüphaneleri kullanılarak farklı modeller oluşturulmuş ve testler yapılmıştır. Oluşturulan modeller eğitilerek elde edilen sonuçların test edilebilmesi için, yüklenen mikroskobik görüntüler için sınıflandırma yapan bir web arayüzü geliştirilmiştir. Model sonucunda tavuk veri seti için %87.75 doğruluk oranıyla, tavşan veri seti için %78.42 doğruluk oranıyla hastalıklı hücreler sınıflandırılabilmektedir.

A model architecture has been developed using the Multi-Layer Neural Network and the Convolutional Neural Network deep learning algorithm to automatically detect Eimeria parasite species and determine if they are diseased. Eimeria microscopic images of chickens and rabbits were used as model inputs.Images have been processed in the OpenCV library. Different models has been obtained using by Keras and Theano libraries. An application with web user interface has been developed that classifies the obtained model for the run and loaded the microscopic image. As a result of models, cell images can be classified with an accuracy of %87.75 for chicken dataset, %78.42 for rabbit dataset.