Mikobakteri türlerinin identifikasyonu için PZR- RFLP (parça uzunluk polimorfizmi) tekniği ve klasik yöntemlerin uygulanması

Abstract

Günümüzde tüberkülozun laboratuar tanısında ve identifikasyonundakarsılasılan zorluklar mevcuttur. Çalısmamızda klasik biyokimyasal identifikasyontestleri ile PZR-RFLP yönteminin karsılastırılması amaçlanmıstır. Bu çalısmada klasikbiyokimyasal identifikasyon teknikleri ile birlikte PZR-RFLP yöntemi kullanılarak,tüberküloz süphesi ile gönderilmis 100 klinik materyalden izole edilen mikobakterilerinhızlı identifikasyonu yapılmıstır. Örneklerin % 43'ü (n=43) kültür yöntemi ile pozitifbulunurken, EZN ve kültür aynı anda % 30'ü (30) pozitif olarak tespit edilmistir.Mycobacterium spp. olarak izole edilen 66 (% 66) örnekten 7'sinin (% 7) atipik oldugugeri kalan 59 (% 59) örnegin MTC oldugu tespit edildi. Klasik identifikasyon sonucunda40 hastanın katalaz testi düsük, nitratı pozitif bulunurken, 30 hastanın niasin testipozitif bulundu. Tüberkülozun laboratuvar tanısında moleküler yöntemler halenstandardize edilememis olup klasik yöntemlerle birlikte klinik ön tanıdegerlendirilmelidir.

There is still various problems at diagnosis and identification of tuberculosis. Theaim of the study is comperasion of biochemical and PCR-RFLP techniques. In ourstudy, 100 clinical specimens suspected by tuberculosis, identificated by PCR-RFLP andclassical methods. It was detected that % 43 (n=43) of samples were culture positivebeside this % 30 of samples were positive for acid-fast bacilli smear and culture at thesame time. PCR-RFLP identified % 66 acid-fast isolates recovered from 100 patientspecimens submitted for culture during the study. The seven isolates were Mycobacteriaother than tuberculosis (MOTT). These isolates were characterized by theirmorphologic and biochemical characteristics too. According to biochemicalidentification % 40 of isolates have low activity for catalase test and positive for nitratetest. % 30 of isolates were positive for niacin test. Molecular identification methodsaren?t standardized so they have to be used with classsical methods in clinical diagnosis.