Show simple item record

dc.contributor.advisorYelekçi, Kemal
dc.contributor.authorŞentürk, Şafak Naz
dc.date.accessioned2020-12-06T09:47:34Z
dc.date.available2020-12-06T09:47:34Z
dc.date.submitted2019
dc.date.issued2019-07-26
dc.identifier.urihttps://acikbilim.yok.gov.tr/handle/20.500.12812/96513
dc.description.abstractBirçok hastalık bir araya gelerek kanseri oluşturur. Kanser hücreleri kontrolsüz bir şekilde bölünür. Kanserde hücre çoğalması anormaldir. Yıllar içinde 200'den fazla kanser çeşidi teşhis edilmiştir. Bazı faktörler kansere neden olabilir. Kalıtım, beslenme, hormonlar, sigara içme, alkol tüketimi, radyasyon, bazı kimyasallar, virüsler ve bakteriler bu faktörlerden birkaçıdır. 2018 yılında 17 milyon yeni kanser vakası ve 9.5 milyon kanser nedenli ölüm gözlenmiştir. Metiyonin aminopeptidaz (MetAP 2) kobalt içeren ve hücrenin sitozolünde bulunan bir metalloproteazdır. Bu enzim yeni sentezlenmiş proteinin amino kısmında bulunan metiyonin amino asidini proteinden ayırır. Ayrıca kanser tedavisinde anjiyojenezi önlemek için yeni peptidomimetik inhibitörler keşfedilmesinde bu enzim kullanılır. Peptidomimetikler peptitlerin işlev ve yapısını taklit etmek için dizayn edilir. Peptitlere göre peptidomimetikler daha yüksek biyoyararlılık ve daha az yan etki gösterir. Bu çalışmada, Discovery Studio adlı program kullanılarak peptidomimetik inhibitörler dizayn edilmiştir. Daha sonra hedef reseptör (MetAP 2) ve inhibitörler birbirlerine bağlanarak en iyi bağlanma modları bulunmuştur. Son olarak Gibbs serbest enerjisi ve ADMET özelliklerine bakılarak en iyi 10 peptidomimetik inhibitör seçilmiştir. MetAP 2 enzimine karşı dizayn edilen bu peptidomimetik inhibitörler yakın gelecekte ilaç dizaynında umut verici işler başaracaktır.
dc.description.abstractSeveral disorders come together to form cancer. Cancer cells divide without a control. The cell proliferation in cancer is abnormal. More than 200 types of cancer have been diagnosed over the years. There are various factors that can cause cancer. These factors are heredity, diet, hormones, smoking, alcohol, viruses, bacteria, radiation and some chemicals. 17 million new cancer cases and 9.5 million cancer deaths were observed in 2018. Methionine Aminopeptidase 2 (MetAP 2) is a cobalt-containing metalloprotease located in cytosol of the cell. It cleaves methionine from amino terminus of a newly synthesized protein. MetAP 2 is a target for discovering new peptidomimetic inhibitors for angiogenesis used as an effective treatment for cancer. Peptidomimetics are designed to mimic peptide function and structure. They show high bioavailability and less side effects than peptides. Here, in this study we designed several peptidomimetic inhibitors using Discovery Studio. We used molecular docking to find best-fit modes between inhibitors and the target, MetAP 2. Lastly, 10 possible peptidomimetic inhibitors were obtained by further analysis such as Gibbs Free Energy and ADMET properties. These peptidomimetic inhibitors will serve as a promising drug candidates for MetAP 2 enzyme in drug design and development in the near future.en_US
dc.languageEnglish
dc.language.isoen
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rightsAttribution 4.0 United Statestr_TR
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.subjectBiyolojitr_TR
dc.subjectBiologyen_US
dc.titleIn silico design and modeling of peptidomimetic drug candidates for methionine aminopeptidase 2 enzyme for prevention of cancer
dc.title.alternativeKanseri engellemek için bilgisayar ortamında dizayn ve modelleme kullanarak metiyonin aminopeptidaz 2 enzimine uygun peptidomimetik ilaç adayları geliştirme
dc.typemasterThesis
dc.date.updated2019-07-26
dc.contributor.departmentBiyoinformatik ve Genetik Anabilim Dalı
dc.identifier.yokid10252229
dc.publisher.instituteLisansüstü Eğitim Enstitüsü
dc.publisher.universityKADİR HAS ÜNİVERSİTESİ
dc.identifier.thesisid548790
dc.description.pages99
dc.publisher.disciplineDiğer


Files in this item

Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

info:eu-repo/semantics/openAccess
Except where otherwise noted, this item's license is described as info:eu-repo/semantics/openAccess