Show simple item record

dc.contributor.advisorCebeci Güler, Nejla
dc.contributor.authorKesti, Saliha
dc.date.accessioned2020-12-04T13:28:38Z
dc.date.available2020-12-04T13:28:38Z
dc.date.submitted2019
dc.date.issued2020-01-14
dc.identifier.urihttps://acikbilim.yok.gov.tr/handle/20.500.12812/87393
dc.description.abstractAmaç: Meyerozyma guilliermondii, fırsatçı insan patojeni olarak kan dolaşımı enfeksiyonu (kandidemi) gibi ciddi enfeksiyonların etkeni bir maya türüdür. Bu çalışmada, M. guilliermondii suşlarının moleküler epidemiyolojik analizlerinde kullanılabilecek Pulse Field Jel Elektroforezi-Genomik DNA'nın Restriksiyon Enzim Analizi (PFGE-REAG) yöntemi için uygun restriksiyon enziminin belirlenmesi amaçlandı. Gereç ve Yöntem: Bu çalışmaya, Karadeniz Teknik Üniversitesi Farabi Tıp Fakültesi Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarında izole edilen, 9 hastanın epidemiyolojik olarak ilişkili 12 M. guilliermondii suşu dahil edildi. PFGE-REAG yöntemi, CHEF DR III (BioRad, ABD) cihaz sistemi kullanılarak SfiI, NotI ve PacI restriksiyon endonükleaz enzimleri ile çalışıldı.Bulgular: SfiI ile kesim reaksiyonu sonucunda, moleküler büyüklük marker'ı aralığına dağılmış ve daha net ayırt edilebilen bantlar izlendi. SfiI ve NotI bant profilleri, karyotipleme bant profilleriyle karşılaştırıldığında; REAG protokolünün karyotiplemeden daha ayırt edici olduğu sonucuna varıldı.Sonuç: REAG-SfiI, epidemiyolojik olarak ilişkili M. guilliermondii suşlarının klonal ilişkisini belirlemede kullanılabilir. Bu çalışmayla, epidemiyolojik olarak ilişkili M. guilliermondii klinik izolatlarının klonal ilişkisinin değerlendirilmesine yardımcı olacak REAG metodunun belirlenmesine katkı sağlandı. Anahtar Kelimeler: Meyerozyma guilliermondii, Pulse Field Jel Elektroforezi, Restriksiyon Enzimi
dc.description.abstractObjective: Meyerozyma guilliermondii is a species of yeast that causes serious infections such as bloodstream infection (candidaemia) as an opportunistic human pathogen. In this study, it was aimed to determine the appropriate restriction enzyme for Pulse Field Gel Electrophoresis- Restriction Enzyme Analysis of Genomic DNA (PFGE-REAG) method which can be used in molecular epidemiological analysis of M. guilliermondii strains.Materials and Methods: In this study, epidemiologically related 12 M. guilliermondii strains of 9 patients isolated in the Medical Microbiology Laboratory of the Medical School Hospital of the Karadeniz Technical University were included. PFGE-REAG method was studied by using CHEF DR III (BioRad, USA) device system with SfiI, NotI and PacI restriction endonuclease enzymes.Results: As a result of restriction reaction with SfiI, bands that were scattered across the range of molecular size markers and were more clearly distinguishable were observed. SfiI and NotI band profiles were compared with the karyotyping band profiles; It was concluded that the REAG protocol was more distinctive than the karyotyping.Conclusion: REAG-SfiI can be used to determine the clonal relationship of epidemiologically related M. guilliermondii strains. This study contributed to the determination of the REAG method which will help to evaluate the clonal relatedness of epidemiologically related M. guilliermondii clinical isolates. Key Words: Meyerozyma guilliermondii, Pulse Field Gel Electrophoresis, Restriction Enzymeen_US
dc.languageTurkish
dc.language.isotr
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rightsAttribution 4.0 United Statestr_TR
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.subjectMikrobiyolojitr_TR
dc.subjectMicrobiologyen_US
dc.titleMeyerozyma guilliermondii` de pulse field jel elektroforezi-genomik DNA`nın restriksiyon enzim analizi için uygun enzimin belirlenmesi
dc.title.alternativeDetermination of suitable enzyme for pulse field gel electrophoresis-restriction enyzme analysis of genomic dna in the meyerozyma guilliermondii
dc.typemasterThesis
dc.date.updated2020-01-14
dc.contributor.departmentTıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı
dc.subject.ytmElectrophoresis
dc.subject.ytmElectrophoresis-agar gel
dc.subject.ytmGenome
dc.subject.ytmDNA
dc.subject.ytmDNA restriction enzymes
dc.subject.ytmMeyerozyma guilliermondii
dc.identifier.yokid10250918
dc.publisher.instituteSağlık Bilimleri Enstitüsü
dc.publisher.universityGİRESUN ÜNİVERSİTESİ
dc.identifier.thesisid546670
dc.description.pages67
dc.publisher.disciplineDiğer


Files in this item

Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

info:eu-repo/semantics/openAccess
Except where otherwise noted, this item's license is described as info:eu-repo/semantics/openAccess