dc.contributor.advisor | Artan, Sevilhan | |
dc.contributor.author | Özlü, Merve | |
dc.date.accessioned | 2023-09-22T11:53:59Z | |
dc.date.available | 2023-09-22T11:53:59Z | |
dc.date.submitted | 2022-11-03 | |
dc.date.issued | 2022 | |
dc.identifier.uri | https://acikbilim.yok.gov.tr/handle/20.500.12812/737191 | |
dc.description.abstract | Başlık: Glioblastoma olgularında PD-L1, PD-L2 ve JAK2 genlerinin ekspresyon paternlerinin ve genomik kopya sayısı değişikliklerinin değerlendirilmesiAmaç: Glioblastoma en yaygın primer beyin tümörü olarak bilinmekte olup, yetişkinlerde insidansı ve nüks oranı yüksek olan bir kanser tipi olarak bilinmektedir. Tüm malign santral sinir sistemi (SSS) tümörlerinin %45'ini, tüm primer malign santral sistemi tümörlerinin %80'ini ve tüm malign gliomaların yaklaşık %54,4'ünü oluşturmaktadır. Fakat glioblastoma için henüz etkili bir tedavi stratejisi olmadığı bilinmektedir. Programlanmış Ölüm Ligandı 1 (PD-L1,CD274)'in, glioblastoma, küçük hücreli dışı akciğer kanseri, melanoma, hematolojik maligniteler dahil olmak üzere birçok malign tümörde yaygın olarak bulunduğu ve yüksek ekspresyon gösterdiği belirtilmektedir. Programlanmış Ölüm Ligandı 2 (PD-L2,CD273)'nin ise gliolastoma, düşük dereceli gliomalar (LGG), akciğer, renal hücreli karsinomlarda da eksprese olduğu bilinmektedir. Janus Kinaz 2 (JAK2) geninin, birçok hücresel süreçte görev yaptığı bilinmektedir. Çalışmamızda diğer kanser tiplerinde oldukça önemli fonksiyonları olan PD-L1, PD-L2 ve JAK2 genlerinin glioblastomada genomik kopya sayısı değişiklikleri ile ekspresyon seviyeleri arasındaki ilişkinin ortaya konmasını amaçladık. Yöntem: 27 parafine gömülü glioblastoma doku örneği ile kontrol grubunu oluşturan 20 parafine gömülü düşük gradeli glial tümör (Grade 1, 2, 3) doku örneğinde PD-L1, PD-L2 ve JAK2 genomik kopya sayısı değişiklikleri FISH yöntemi, ilgili genlerin ekspresyon seviyeleri RT-PCR ile tespit edilip, iki yöntem arasındaki ilişki değerlendirilmiştir. Bulgular: Çalışma sonucunda, 47 olgunun 44'ü PD-L1, PD-L2 gen bölgeleri açısından en az bir aberasyon gösterirken, 25 olgu amplifikasyon açısından pozitif olarak saptanmıştır. JAK2 gen bölgesi 17 olguda yeniden düzenlenme pozitif olarak tespit edilmiştir. Glioma dereceleri ve PD-L2 gen ekspresyon seviyesi arasında anlamlı bir fark saptanmıştır. Ek olarak, grade 2 ve 3 olgularında PD-L2 gen amplifikasyonu ve ekspresyon düzeyi arasında ilişki saptanmıştır. Sonuç: Glioblastomadan bağımsız olarak PD-L2 gen amplifikasyon ve ekspresyon seviyelerine grade 2 ve 3 glial tümörlerde bakılması teşhis ve tedavi açısından etkili olabileceğini düşündürmektedir. | |
dc.description.abstract | Title: Evaluation of expression patterns and genomic copy number changes of PD-L1, PD-L2 and JAK2 genes in glioblastoma casesAim: Glioblastoma is known as the most common primary brain tumor and is known as a cancer type with a high incidence and recurrence rate in adults. It constitutes 45% of all malignant central nervous system (CNS) tumors, 80% of all primary malignant central system tumors and approximately 54.4% of all malignant gliomas. However, it is known that there is no effective treatment strategy for glioblastoma yet. It has been reported that Programmed Death Ligand 1 (PD-L1,CD274) is widely found and highly expressed in many malignant tumors, including glioblastoma, non-small cell lung cancer, melanoma, and hematological malignancies. Programmed Death Ligand 2 (PD-L2,CD273) is known to be expressed in gliolastoma, low-grade gliomas (LGG), lung, and renal cells. The Janus Kinase 2 (JAK2) gene is known to be involved in many cellular processes. In our study, we aimed to investigate the relationship between genomic copy number changes and expression levels of PD-L1, PD-L2 and JAK2 genes, which have very important functions in other cancer types, and to reveal their relationship with clinical data of the cases.Method: PD-L1, PD-L2 and JAK2 genomic copy number changes in 27 paraffin-embedded glioblastoma tissue samples and 20 paraffin-embedded low-grade glial tumor (Grade 1, 2, 3) tissue samples in the control group FISH method, expression levels of related genes with RT -PCR was determined and the relationship between the two methods was evaluated.Results: As a result of the study, 44 of 47 cases showed at least one aberration in terms of PD-L1, PD-L2 gene regions, while 25 cases were positive for amplification. Rearrangement was positive in 17 cases for the JAK2 gene region. A significant difference was found between glioma grades and PD-L2 gene expression level. In addition, a correlation was found between PD-L2 gene amplification and expression level in grade 2 and 3 cases. Conclusion: As glioblastoma predicts predictability and predictability in PD-L2 gene amplification and expression levels in 2 and 3 class 2 and 3 insights. | en_US |
dc.language | Turkish | |
dc.language.iso | tr | |
dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | |
dc.rights | Attribution 4.0 United States | tr_TR |
dc.rights.uri | https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ | |
dc.subject | Genetik | tr_TR |
dc.subject | Genetics | en_US |
dc.title | Glioblastoma olgularında PDL1, PDL2 ve JAK2 genlerinin ekspresyon paternlerinin ve genomik kopya sayısı değişikliklerinin değerlendirilmesi | |
dc.title.alternative | Evolution of PDL1, PDL2 ve JAK2 genes expression patterns and genomic copy number changes in glioblastoma cases | |
dc.type | masterThesis | |
dc.date.updated | 2022-11-03 | |
dc.contributor.department | Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı | |
dc.identifier.yokid | 10301115 | |
dc.publisher.institute | Sağlık Bilimleri Enstitüsü | |
dc.publisher.university | ESKİŞEHİR OSMANGAZİ ÜNİVERSİTESİ | |
dc.identifier.thesisid | 736501 | |
dc.description.pages | 108 | |
dc.publisher.discipline | Tıbbi Genetik Bilim Dalı | |