Viral hemorajik septisemi virusunun (vhsv) fenotipik karakterinin virulans üzerine etkisinin araştırılması
dc.contributor.advisor | Albayrak, Harun | |
dc.contributor.author | Çiçek, Yasemin | |
dc.date.accessioned | 2021-05-08T10:59:10Z | |
dc.date.available | 2021-05-08T10:59:10Z | |
dc.date.submitted | 2018 | |
dc.date.issued | 2018-10-08 | |
dc.identifier.uri | https://acikbilim.yok.gov.tr/handle/20.500.12812/677778 | |
dc.description.abstract | Amaç: Viral Hemorajik Septisemi Virusu (Piscine novirhabdovirus), deniz ve tatlı su balıklarında enfeksiyonlara neden olan virustur. Bu çalışmada; Türkiye'de tatlı suda (Gökkuşağı alabalığı) ve denizde (Kalkan balığı) yaşayan balıklardan izole edilen Bolu/06 ile TR-WS13G adlı iki VHSV izolatının farklı fenotiplerinin gökkuşağı alabalıklarındaki (Oncorhynchus mykiss) klinik bulgular, mortalite oranı ve patojenitesi üzerine etkisinin belirlenmesi amaçlanmıştır.Materyal ve Metot: Bu çalışmada; Bolu/06 ve TR-WS13G VHSV izolatları plak saflaştırma yöntemiyle saflaştırıldı. Test sonunda her iki izolata ait dar ve geniş plak oluşturan 4 farklı saflaştırılmış izolat 60-100 g ağırlığındaki gökkuşağı alabalıklarına intraperitonal olarak verilerek deneysel enfeksiyon oluşturuldu. Deneysel enfeksiyon sırasında ölen veya deneme sonucunda öldürülen balıklarda realtime PCR metodu ile VHSV viral nükleik asit varlığı ve miktarı araştırıldı.Bulgular:Deneysel enfeksiyon sonucunda mortalite oranı; kontrol grubunda %3,33, Bolu/06 dar plak izolat grubunda % 43,3, Bolu/06 geniş plak izolat grubunda %20, TR-WS13G dar plak izolat grubunda %33,3, TR-WS13G geniş plak izolat grubunda %14,8 olarak tespit edildi. rRT PCR testi sonucunda ölen/öldürülen balık örneklerinde 7,33x104-1,67x102/µl arasında viral kopya sayısı tespit edildi. Balık organ örneklerinde en yoğun CT değeri 28,35 olarak kaydedildi. Hastalığın açık klinik belirtileri enfekte edilme sonucu ölen balıkların tamamında gözlemlendi.Sonuç: Fenotipik karakter olarak geniş ve dar plak oluşturan hem tatlı su izolatı Bolu/06 hem de deniz izolatı TR-WS13G'nin dar plak çapına sahip izolatlarının geniş plak oluşturan izolatlarından daha yüksek mortaliteye neden olduğu, gökkuşağı alabalıklarından izole edilen tatlı su izolatı Bolu/06'nın kalkan balığından izole edilen deniz izolatı TR-WS13G'den daha patojen olduğu ortaya konulmuştur. Bu sonuçla; fenotipik karakterin virulans üzerinde önemli düzeyde etkili olduğu gösterilmiştir. Anahtar Kelimeler: Plak Test; rRT PCR; Viral Hemorajik Septisemi Virusu; Gökkuşağı alabalığı | |
dc.description.abstract | Aim: Viral Hemorrhagic Septicemia Virus (Piscine novirhabdovirus) is a virus that causes infection in various marine and freshwater fish. It was aimed to determine the effect of different phenotypes of two VHSV isolates, Bolu/06 and TR-WS13G, isolated from fish living in freshwater (rainbow trout) and sea (turbot) in Turkey, on clinical findings, mortality rate and pathogenicity in Rainbow trout (Oncorhynchus mykiss).Material and Method: In this study, Bolu/06 and TR-WS13G VHSV isolates were purified by plaque purification method. At the end of the test, 4 different purified isolates, which form wide-narrow plaques of both isolates, were given intraperitoneally to rainbow trout weighing 60-100 g and experimental infection was performed. VHSV viral nucleic acid presence and quantity were investigated by realtime PCR method in dead or killed fish during experimental infection.Results: Mortality rate due to experimental infection were detected as; %3.33 for control group; %43.3 for Bolu/06 narrow isolates group, %20 for Bolu/06 wide isolates group, %33.3 for TR-SW-13 narrow isolates group; and %14.8 for TR-SW-13 wide isolates group. The number of viral copies in the fish samples (dead/killed) were found to be 7.33x104-1.67x102/μl by rRT-PCR. The most intensive CT value in the fish organ samples was recorded as 28.35. The clinical symptoms of the disease were observed in all of the fish that died as a result of infection.Conclusion: The phenotypic character of the wide narrow- plaque forming isolates freshwater isolation Bolu / 06 and marine isolation TR-WS13G, have a higher mortality rate than wide plaque-forming isolates of narrow-plate isolates. Freshwater isolation from rainbow trout isolation Bolu/06 more pathogenic than turbot isolated from marine isolate TR-WS13G. This result showed phenotypic character has been shown to be significantly effective on virulence.Keywords: Plaque Test; rRT PCR; Viral Hemorrhagic Septicemia Virus; Rainbow Trout | en_US |
dc.language | Turkish | |
dc.language.iso | tr | |
dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | |
dc.rights | Attribution 4.0 United States | tr_TR |
dc.rights.uri | https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ | |
dc.subject | Veteriner Hekimliği | tr_TR |
dc.subject | Veterinary Medicine | en_US |
dc.title | Viral hemorajik septisemi virusunun (vhsv) fenotipik karakterinin virulans üzerine etkisinin araştırılması | |
dc.title.alternative | Research of the viral hemorrhagic septisemia virus (vhsv) phenotypic characteristics effect on virulence | |
dc.type | masterThesis | |
dc.date.updated | 2018-10-08 | |
dc.contributor.department | Viroloji Ana Bilim Dalı | |
dc.subject.ytm | Sepsis | |
dc.subject.ytm | Hemorrhage | |
dc.subject.ytm | Polymerase chain reaction | |
dc.subject.ytm | Rainbow trout | |
dc.subject.ytm | Piscine novirhabdovirus | |
dc.identifier.yokid | 10179613 | |
dc.publisher.institute | Sağlık Bilimleri Enstitüsü | |
dc.publisher.university | ONDOKUZ MAYIS ÜNİVERSİTESİ | |
dc.identifier.thesisid | 487468 | |
dc.description.pages | 51 | |
dc.publisher.discipline | Diğer |