Phenotypic and genotypic investigation of metallo beta lactamase in acinetobacter strains isolated from clinical samples

Abstract

Acinetobacterlerin olusturdukları infeksiyonlarda antibiyotiklere olan dirençleriönemli bir sorun haline gelmistir. Karbapenemlere dirençli olan Acinetobacterkökenlerinin diğer antimikrobiyallere karsı da oldukça dirençli olmaları infeksiyonhastalıklarının tedavisini güçlestirmektedir.Bu çalısmada klinik örneklerden izole edilen Acinetobacter kökenlerindemetallo beta laktamaz (MBL) varlığının fenotipik ve genotipik yöntemlerlearastırılması amaçlandı. Çalısmaya 150 Acinetobacter spp. kökeni dahil edildi.Kökenlerin antimikrobiyal duyarlılıkları otomatize sistemle, metallo beta laktamazüretimi E-test yöntemiyle arastırıldı. IMP ve VIM genlerinin saptanması için polimerazzincir reaksiyonu (PZR) yöntemi kullanıldı.Çalısmamızdaki kökenlerin %94'ünün Acinetaobacter baumannii %6'sının A.Iwofii olduğu tespit edildi. Kökenlerin en duyarlı olduğu antibiyotiklerin sırasıylagentamisin (%41,3), amikasin (%36,7), imipenem (%25,3) olduğu saptandı.Seftriakson (%92), levofloksasin (%84,7), seftazidim (%84), piperasilin/tazobaktam(%84) ise en dirençli oldukları antibiyotiklerdi. Kökenlerin 67 (%44,7) 'si E-testyöntemiyle MBL pozitif olarak bulundu. MBL pozitif bulunan kökenlerin imipeneme,meropeneme, seftazidime, seftriaksona, gentamisine, pipeasilin/tazobaktama dahadirençli olduğu saptandı. PZR yöntemiyle arastırılan blaIMP-1, blaIMP-2, blaVIM-1 veblaVIM-2 genleri hiçbir kökende tespit edilmedi.MBL genlerinin ortaya çıkması ve bakteriyel patojenler arasındaki yayılımlarıantimikrobiyal tedavilerin etkisini azaltmaktadır. Bu nedenle MBL'lerin ve onlarıkodlayan genleri tasıyan kökenlerin saptanması tedavide kullanılabilecek antibiyotikseçiminde faydalı, daha etkili tedavi yöntemleri için de yol gösterici olacaktır.Anahtar Kelimeler: Acinetobacter, metallo beta laktamaz, IMP, VIM

The resistance of Acinetobacter strains to antibiotics has become major problemin infections caused by them. Acinetobacter strains which are resistant to carbapenems,also have higher resistance to the other antimicrobials. So this condition impedes thetreatment of infectious diseases.In this study it was aimed to investigate the presence of metallo beta lactamase(MBL) in Acinetobacter strains isolated from clinical samples with fenotypic andgenotypic methods. 150 Acinetobacter strains were included into the study.Theantimicrobial susceptibilities of the strains were determined with automated system,production of metallo beta lactamase were investigated with E test method. Polimerasechain reaction (PCR) method was used for determining the blaIMP and blaVIM genesIn our study, it was determined that 94% of strains were Acinetaobacterbaumannii, 6% of strains were A. Iwofii. The antibiotics which the strains were mostlysusceptible to, were detected as gentamicin (41,3%), amikacin (36,7%), and imipenem(25,3%). Ceftriaxone (92%), levofloxacin (84,7%), ceftazidime (84%),piperacillin/tazobactam (84%), were the antibiotics to which the strains were the mostresistant. 67 (44,7%) of the strains were found MBL positive with E test nethod. Andthsese strains were detected more resistant to imipenem, meropenem, ceftazidime,ceftriaxone. blaIMP-1, blaIMP-2, blaVIM-1 and blaVIM-2 genes were detected in no strainwith PCR method.The emergence of MBL genes and spread among the bacterial pathogensreduces the effect of antimicrobial treatments. Therefore detecting MBLs and thestrains that carry the genes encoding MBLs will be helpful in the selection ofantibiotics that can be used in treatment, and also will be a guide for more effectivetreatments.Key Words: Acinetobacter, metallo beta laktamase, IMP, VIM