Alcohol dehydrogenase and aldehyde dehydrogenase gene polymorphism in Turkish alcoholic people and control group

Abstract

Bu tez çalımasında alkolik ve alkolik olmayan Türklerde alkolmetabolizmasında önemli rol oynayan enzimleri kodlayan alkol dehidrogenaz ve aldehitdehidrogenaz genlerinin polimorfizmleri günümüzde en yaygın kullanılan SingleNükleotid Polimorfizm (SNP) belirleme metodları kullanılarak belirlenmitir.Çalımadaki temel amaç, ADH2, ADH3 ve ALDH2 gen polimorfizmleri ile Türk ırkınınalkole karı tolerans gelitirme eilimi arasındaki ilikiyi saptamaktır. Dier önemliamaç ise, Türk ırkındaki ADH2, ADH3 ve ALDH2 genlerine ait polimorfizm tiplerinidünyadaki dier ırklarla ve etnik gruplarla karılatırmaktır. Çalımada 141 alkolikhasta için ADH3 genotiplemesi ve 156 alkolik hasta için de ADH2 ve ALDH2genotiplemeleri yapılmıtır. Kontrol grubu ise 80 salıklı alkol kullanmayan bireydenolumutur. Bu çalımada üç farklı SNP genotipleme metodu kullanılmıtır. ADH3genotiplemesi için RFLP-PCR, ADH2 genotiplemesi için allel spesifik primer extensionmetodu, ALDH2 genotiplemesi için ise Multiplex PCR metodu kullanılmıtır. Alkolik vealkolik olmayan gruplarda tüm ADH2 genotipleri içinde en yaygın olarak ADH2.1genotipi bulunmutur. Bununla birlikte ADH2 genotipleri açısından genel olarakkontrol grubuyla alkolik grup arasında anlamlı bir fark bulunmamıtır. ki grup içindeyapılan ADH3 genotiplemesinde ADH3.2 genotipi oranının ADH3.1 genotipi oranındanyüksek olduu bulunmutur. Alkolik grupta ADH3.2 genotipinin kontrol grubundanyüksek olduu bulunmutur. ncelenen alkolik grup ve kontrol gruplarının her ikisindede ALDH2.1 genotipi %100 oranında saptanmıtır. Sonuç olarak, ADH2 genindekivaryasyonların Türklerde alkolizme katkısının olmadıı, buna karılık ADH3 veALDH2 genlerindeki varyasyonların Türk insanını alkol baımlılıı gelitirmeye karıeilimli yapabilecei söylenebilir. Tüm sonuçlar gözüne alındıında ise Türk ırkınınADH ve ALDH genlerinin alkole karı hassasiyeti ve alkol baımlılıını arttırmaeiliminde olan genetik varyasyonlarına sahip olduu çıkarımı yapılabilir. Elde edilensonuçlar Asya toplumununkinden önemli ölçüde farklı ve beklendii üzere Avrupatoplumu dahil dünya genelindeki beyaz ırkla uyumlu bulunmutur.

In this study, alcohol dehydrogenase and aldehyde dehydrogenase gene, encodingalcohol metabolizing enzymes, polymorphisms were determined in alcoholic and nonalcoholicTurkish people by using effective, commonly used single nucleotide polymorphismdetermination methods. The main objective in the study was to investigate the relationship ofADH2, ADH3 and ALDH2 gene polymorphism with the tendency of Turkish people todevelop alcohol tolerance. The other significant objective was to compare polymorphismtypes of ADH2, ADH3 and ALDH2 seen in Turkish people and other ethnic groups or racesin the world. In this present study, ADH3 genotypes of 141 alcoholic subjects, and also ADH2and ALDH2 genotypes of 156 alcoholic subjects were assigned. The control group consisted of80 healthy non-drinkers. Three different SNP genotyping methods were used in this study.ADH3 genotyping was performed using polymerase chain reaction-restriction fragmentlength polymorphism method (RFLP-PCR). ADH2 genotyping was performed by allelespecific primer extension method and ALDH2 genotyping was performed by multiplex PCRby using two allele specific primer pairs. The ADH2.1 genotype was the most common type ofall ADH2 genotypes in both alcoholic and non alcoholic groups. However, there was nosignificant difference between alcoholic and non alcoholic groups for ADH2 genotyping.ADH3 genotyping of both groups suggested that the ADH3.2 genotype frequency was higherthan ADH3.1. ADH3.2 was found to be more prevalent in alcoholics compared to controlgroup, suggesting that alcoholics were more tolerant to alcohol. In all of the alcoholic and nonalcoholicsubjects examined, the frequency of ALDH2.1 was found to be 100%. Finally, it canbe inferred from that obtained results, ADH2 genetic variations seem not to be related toalcoholism. On the other hand, ADH3 and ALDH2 genetic variations can make Turkishpeople susceptible to alcohol dependency. If all the results are taken into consideration, it isinferred that Turkish people have the inherited variations of ADH and ALDH genes which donot protect them to have alcohol sensitivity and dependency. Obtained results in the study areconsistent with the white race in the world including European people but not consistent withOriental people as expected.