Determination of genetic diversity between eggplant and its wild relatives

Abstract

Patlıcan (Solanum melongena L.) gittikçe artan bir tanınma ile önemliürünlerden bir tanesidir ve u anda küresel olarak üretilmektedir. Özellikle Hindistanbata olmak üzere, birincil çeitlilik merkezi olan Asya kıtasında, insan beslenmesindeönemli bir yeri vardır. Üretim miktarı bakımından Türkiye, Avrupa' da birinci vedünya da da ilk be ülke arasındadır. S. melongena'nın ait olduu Solanaceae ailesi deönemlidir. 3000-4000 türün yer aldıı bu önemli aile, morfolojik olarak yüksek düzeydeçeitlilik göstermektedir ve bu çeitlilik sistematik açıdan çeitler, türler ve cinslerseviyesindedir.Bu tezde yapılan çalımaların amacı, Türk patlıcanları ve yabani akrabalarıarasındaki genetik çeitlilii ayrı ayrı ve farklı moleküler teknikler kullanarakbelirlemektir. Türkiye'de yetitirilen patlıcan kültürleri arasındaki genetik çeitliliiaçıa çıkarmak üzere, AFLP iaretleyici sistemi örnek genotiplere uygulanmıtır. S.melongena ve yabani akrabaları arasındaki genetik varyasyonu aratırmak için ise SSRiaretleyici sistemi kullanılmıtır.Türk patlıcanları AFLP verileri için, 0.97 r deeri bulunmutur. Bu deer en iyiaralık dahilinde yer almıtır. Ayrıca, rapor edilen Eigen deerleri de oldukça açıklayıcıbulunmutur. Bu sonuçlar, örnekler arasındaki çeitliliin temel bileenler analizi ile ilkdüzlemde %64.34 oranında açıklandıını göstermitir. Üç düzlemde ise, toplamvaryasyonun %72.21' i açıklanmıtır. SSR analizlerinin istatistiksel sonuçlarına göre,Solanum türleri genotipik verilerinin r deeri 0.88 bulunmutur. Bu sonuç, örnekgenotipik data ve dendrogram arasında bulunan ilikinin yüksek olduu anlamındadır.Dier istatistiksel sonuçlara göre, Eigen deerleri, temel bileenler analizi ile ilkdüzlemde genotiplerin %46.12' sini açıklamıtır. Toplam %55.28' lik deer ile, 47 farklıgenotip, temel bileenler analizindeki ilk üç düzlemde açıklanmıtır.AFLP çalımalarının sonuçları, yüksek düzeyde benzerlik deeri gözlenmesineramen, tohum örnekleri arasında varyasyonun tespit edilebileceini göstermitir. SSRçalımalarının sonuçları, önceki çalımalarla uyumlu ve tespit edilen çeitlilik iseistatistiksel olarak anlamlı bulunmutur.

Eggplant (Solanum melongena L.) is an important crop and has a growingreputation and is now cultivated globally. It is a valuable member of the human diet inAsia, especially in India, which is a primary diversity center of the species. Turkey is thefirst in Europe and is in the first five countries around the world in terms of eggplantproduction. The Solanaceae family to which S. melongena belongs is an importantfamily, too. Tomato, potato, tobacco and petunia are some example species of theSolanaceae family. This important family with 3000-4000 species shows a high level ofmorphological diversity which results in confusion about its systematics and thisdiversity is at the level of genera, species and cultivars.The aims of the studies reported in this thesis were to analyze genetic diversity ofTurkish eggplants and wild relatives in separate studies with different molecular tools.To reveal genetic diversity among eggplant cultivars grown in Turkey, the AFLPmarker system was applied to the sample genotypes. For the investigation of geneticvariation between S. melongena and its wild relatives, though, the SSR marker systemwas used.For the AFLP data for Turkish eggplants, an r value of 0.97 was obtained whichwas in the best scale. Eigen values reported here were also informative. These resultsshowed that the first component analysis explained 64.34% of the variation betweensamples. For three axes, though, a total of 72.21% variation was explained. According tothe statistical results of SSR analysis, the r value of Solanum species? genotypic data wasfound to be 0.88. That means the correlation between sample genotypic data anddendrogram was found to be high. Due to the other statistical results which were Eigenvalues explained 46.12% of genotypes for first component analysis. With a total value of55.28%, the 47 different genotypes were explained by the three principle component axes.The results of AFLP studies showed that although a high similarity value wasobserved, diversity was detectable among the accessions. The results of SSR studies werealso meaningful with their concordance with previous studies and observed diversitywith a good fit to statistical results.