Structural and electronic factors affecting mutagen activity of organic compounds

Abstract

ORGANİK BİLEŞİK SERİLERİNDE YAPI-KALTITM AKTMTESİNİ ETKİLEYEN ELEKTRONİK VE YAPISAL FAKTÖRLER Yüksel KÖSEOGLU Master Tezi Tez Danışmanı: Prof. Dr. Anatoli DİMOGLO Tez Eşdanışmanı: Prof. Dr. Mustafa KUMRU Kalıtım aktivitesi, Yapı-activite ilişkileri (QSAR), Complete Neglect of Differential Overlap (CNDO/2), Hartree-Fock metot, Elektron Topolojik Metot (ETM) ÖZET Bu çalışmada, kalıtım özelliği gösteren yada göstermeyen olmak üzere farklı yapılardaki organik moleküller incelendi. Bu bileşikler aktif (28 molekül) ve inaktif (38 molekül) olmak üzere iki guruba ayrıldı. Aktif bileşik örnekleri aşağıdaki gibidir. N02 Aktif bileşik örnekleri. Başlangıç olarak, bütün moleküllerin elektronik ve geometrik parametreleri PM modeli ve CNDO/2 metodu ile hesaplandı.Bu hesaplamaların sonuçlan ETM metodu kullanılarak bütün bileşiklerin elektron topolojik matrisleri (ETMC) oluşturuldu. Oluşturulan bu matrislerin bir ayar bileşiğinin ( prensip olarak en aktif olanı) matrisi ile karşılaştırılması sonucu, ` Aktivite özelliği` olarak adlandırılan ve bütün aktif bileşiklerin ETMC'lerinde bulunan bir altmatris (ETSA) olarak, aktiviteden sorumlu bir moleküler fragment bulundu. Aynı şekilde, inaktivite özelliği gösteren bir altmatris bulundu. Böylelikle kalıtım aktivitesinin bağlı bulunduğu elektronik ve geometrik parametreler bulunmuş oldu. Benzer şekilde, inaktivite özelliğini belirleyen yani aktiviteyi kinci olarak hangi elektronik ve geometrik parametrelerin önemli olduğu belirlendi.

IV STRUCTURAL AND ELECTRONIC FACTORS AFFECTING MUTAGEN ACTIVITY OF ORGANIC COMPOUNDS Yüksel KÖSEOGLU M.S. Thesis, 1999 Thesis Advisor: Prof. Dr. Anatoli DIMOGLO Thesis Co-advisor: Prof. Dr. Mustafa KUMRU Keywords: Mutagenic activity, Structure-activity relationships (SAR), CNDO/2, Hartree- Fock method, Electron Topological Method (ETM) ABSTRACT In this work we investigated different types of organic molecules which possesing or non-possessing mutagenic activity. Preliminary calculations of the electronic and geometric parameters have been carried out in order to form the so-called electron- topological matrices of contiguity (ETMC) for every compound from the series given. N02 Typical skeletons of the active compounds. As a result of the matrices comparison, a molecular fragment responsible for the activity in view has been found as a common submatrix in all ETMC of active compounds and called ` the activity feature`. A submatrix for the molecular fragment representing the feature of inactivity, has been revealed, too. The properties of the features have been studied and used as a set of rules for the activity in view prediction in the series of new compounds.