Electron topological approach in the inhibitory activity investigation for new compounds design

Abstract

İNHİBİTÖR AKTİVİTESİ GÖSTEREN YENt BİLEŞİKLERİN DİZAYNINDA ELEKTRON TOPOLOJİK YAKLAŞIM Ahmet ALTUN Yüksek Lisans Tezi, 1999 Tez Danışmanı: Prof. Dr. Anatoli DÎMOGLO Tez Eş Danışmam: Prof Dr. Mustafe KUMRU Anahtar kelimeler: Yapı Aktivite İlişkisi, CNDO Metodu, Elektron Topolojik Metot, Herpes Simpleks Virus (HSV), inhibitor Aktivitesi ÖZET Bu tezde; thiosemikarbazon türevlerinin bir serisine ait 60 bileşik üzerinde yapı aktivite ilişkisi araştırıldı. İnceleme altındaki bütün bileşikler potansiyel olarak HSV-1 için inhibitor aktivitesi göstermektedirler. Serideki her bir bileşik için elektron ve geometri parametreleri hesaplanarak elektron topolojik matrisler oluşturuldu. Bu matrislerin karşılaştırılması ile aktivite gösteriminden sorumlu iki fragment (aktivite özellikleri) elektron topolojik alt matrisler olarak ortaya çıkarıldı. Ayrıca, aktiviteyi kıran üç özellik bulunduğu gözlendi Elektron ve yapı parametreleri ile serideki bileşiklerin aktivitesi arasında nasıl bir korelasyon olduğu ortaya çıkarıldı. Regresyon analizi yardımıyla aktiviteyi sayısal olarak bulabileceğimiz bir model geliştirildi. Elektron ve yapı parametrelerinin hesaplanmasının ardından herhangi bir bileşiğin aktif olup olmadığının tespit edilebileceği ve yeni aktif bileşiklerin dizayn edilebileceği prognos sistemi geliştirildi.

IV ELECTRON TOPOLOGICAL APPROACH IN THE INHIBITORY ACTIVITY INVESTIGATION FOR NEW COMPOUNDS DESIGN Ahmet ALTON MS. Thesis, 1999 Thesis Advisor: Prof. Dr. Anatoli DIMOGLO Thesis Co-advisor: Prof. Dr. Mustafa KUMRU Keywords: Structure-Activity Relationships (SAR), Method of CNDO, Electron Topological Method (ETM), Herpes Simplex Virus (HSV), Inhibitory Activity ABSTRACT In this thesis, the relationships between the structure of the compounds and their activity have been investigated in a series of thiosemicarbazone derivatives (60 compounds) by means of the Electron Topological Method. All derivatives are potent inhibitors of HSV-1 replication. Electronic and geometry parameters obtained after preliminary calculations have been used to form the so-called Electron Topological Matrices of Conjunction (ETMC) for each compound in the series given. Two molecular fragments that are responsible for activity demonstration have been revealed. In addition to activity features, three fragments of inactivity that are obstacle for activity demonstration have also been revealed. The correlation among electronic, structural parameters and activity of the compounds in view has been revealed. A quantitative model by means of regression analysis has been improved. The system of prognostication developed on the base of data obtained can be used for screening and search of new active compounds.