Kırım kongo kanamalı ateşi hastalarında hulc ve 7SL RNA ifade düzeylerinin araştırılması

Abstract

Kırım Kongo kanamalı ateşi (KKKA), Kırım Kongo kanamalı ateş virüsünün (KKKAV) neden olduğu kene kaynaklı bir hastalıktır. Uzun kodlama yapmayan RNA'lar (lncRNA'lar) genellikle 200 nükleotitten daha uzun transkriptler olarak sınıflandırılırlar. Viral enfeksiyonlar lncRNA'lar da dahil olmak üzere hücre transkriptomunda güçlü değişiklikler meydana getirmektedirler. Enfekte olmuş hücrelerde ifade olan çeşitli lncRNA'lar viral ve konak genlerinin ekspresyonunu düzenlemede görev almaktadırlar. Son yıllarda, bazı lncRNA'ların terapötik hedefler ve hastalığın ilerlemesinde prognostik belirteçler olarak kullanılabileceği düşünülmektedir. Bu çalışma KKKA hastalarında HULC ve 7SL RNA ekspresyon düzeylerinin araştırıldığı ilk çalışmadır. Bu amaçla, 100 bireyin (60 hasta ve 40 kontrol) kan örnekleri alındı ve total RNA izolasyonu yapıldı. Çalışma popülasyonunda HULC ve 7SL RNA ekspresyon düzeylerini belirlemek için SYBR Green yöntemi kullanılarak kantitatif polimeraz zincir reaksiyonu (qPCR) gerçekleştirildi.Hasta ve kontrol grubu karşılaştırıldığında, hastalarda HULC ekspresyon seviyesinin artışı istatistiksel olarak anlamlı bulundu (p=0.04). 7SL RNA ifadesinin hastalarda 1.88 kat azaldığı (p=0.93) gözlendi. Ayrıca hastalarla karşılaştırıldığında ölenlerde HULC'un ifadesinin 100 kat arttığı (p<0.01) ve 7SL RNA'nın ifadesinin ise azaldığı (1.04 kat, p=0.03) tespit edildi. Bunlara ek olarak uluslararası normalize edilmiş oran (INR) ve protrombin zamanı (PT) normal değerlerin üzerinde olan hastalarla normal değerler arasında olanlar karşılaştırıldığında INR ve PT'si normal değerin üzerinde olanlarda HULC ifadesinin 3 kat artması istatistiksel olarak önemli bulundu (p=0.01 ve p=0.02, sırasıyla). Klinik parametreleri normalin üzerinde olan ölmüş ve hayatta kalan hastalar karşılaştırıldığında ölmüş bireylerde HULC ifadesi artmıştır. HULC; aspartat aminotransferazı (AST) yüksek olanlarda 90 kat (p<0.01), alanin aminotransferazı (ALT) yüksek olanlarda 80 kat (p<0.01), PT'si yüksek olanlarda 165 kat (p=0.01), aktive parsiyel tromboplastin zamanı (aPTT) yüksek olanlarda 131 kat (p<0.01) ve laktat dehidrogenazı (LDH) yüksek olanla da 97 kat (p<0.01) artmıştır. Bulgularımız HULC ve 7SL RNA'nın KKKA hastalığının patogenezinde önemli oluğunu göstermektedir.

Crimean-Congo hemorrhagic fever (CCHF) is a tick-borne disease caused by the Crimean-Congo hemorrhagic fever virus (CCHFV). Long non-coding (lncRNAs) are generally classified as transcripts longer than 200 nucleotides. Viral infections cause strong changes in cell transcriptomics, including lncRNAs. The various lncRNAs expressed in infected cells are responsible for regulating the expression of viral and host genes. In recent years, it has been thought that some lncRNAs may be used as therapeutic targets and prognostic markers in the progress of disease. This is the first study to investigate HULC and 7SL RNA expression levels in CCHF patients. For this purpose, blood samples were taken from 100 individuals (60 patients and 40 controls) and total RNA isolation was performed. Quantitative polymerase chain reaction (qPCR) was performed using the SYBR Green method to determine HULC and 7SL RNA expression levels in the study population.When the patient and control groups were compared, the increase in HULC expression level in the patients was statistically significant (p=0.04). 7SL RNA expression was decreased 1.88 times (p=0.93) in patients. It was also found that the expression of HULC was increased 100 fold (p<0.01) and 7SL RNA was decreased (1.04 fold, p=0.03) in fatal cases when compared to patients. In addition, HULC was increased 3 fold in patients who have higher international normalized ratio (INR) and prothrombin time (PT) values compared with patients with normal values and these were found statistically significant (p=0.01 and p=0.02, respectively). HULC was increased in the fatal cases with higher clinical parameters compared with patients with higher values. HULC expression in fatal cases with higher aspartate aminotransferase (AST), alanine aminotransferase (ALT), PT, active partial thromboplastin time (aPTT), and lactate dehydrogenase (LDH) increased 90 (p<0.01), 80 (p<0.01), 165 (p=0.01), 131 (p<0.01) and 97 fold (p<0.01), respectively. Our findings show that HULC and 7SL RNA are important in the pathogenesis of CCHF disease.