Non-fonksiyonel hipofiz adenomu patogenezinin transkriptom analizleri ile incelenmesi

Abstract

Non-Fonksiyonel Hipofiz Adenomu Patogenezinin Transkriptom Analizleri ileİncelenmesiAmaç: Hipofiz adenomlarının yaklaşık %25-30 'unu non-fonksiyonel hipofizadenomları oluşturmaktadır. Non -fonksiyonel hipofiz adenomlarının %40 'ı invazyongösterirler. İmmünohistokimyasal çalışmalar, moleküler biyoloji teknikleri ve in vitroçalışmalar non-fonksiyonel adenomların daha detaylı sınıflandırılmasına olanaksağlamıştır. Amacımız; Non-Fonksiyonel hipofiz adenomları patogenezinin gen ağlarıve yolak analizleriyle mRNA düzeyinde araştırılmasıdır.Yöntem: Çalışmamızda, Kocaeli Üniversitesi Tıp Fakültesi Nöroşirürji AnabilimDalı'na başvuran non-fonksiyonel hipofiz adenomu tanısı almış 45 tümör dokusu, 8normal hipofiz dokusunda gen ekspresyonu mikroarray çalışması yapıldı. IPA analiziylenon-fonksiyonel hipofiz adenomları ile ilgili sinyal yolakları ve PPE (protein-proteinetkileşimi) ağları oluşturarak tümör oluşumuna sebep olan anahtar genler tespit edildi.Bulgular: Yaptığımız mikroarray analizleri sonucunda 2698 genin ekspresyondeğişikliği saptandı. Bu genlerden 270'nin ekspresyonun arttığı, 2428'nin ekspresyonunazaldığı tespit edildi. Ekspresyonun en çok arttığı gen CASKIN2, ekspresyonun en çokazaldığı gen S100A7A olarak bulundu. PPE ağında saptanan anahtar genler şunlardı:CCND1, BRCA1, HNF1A, POU5F1, GATA4, SOX2, NUPR1ve FOXA1.Sonuç: Yapılan bu mikroarray analizi sonucunda CCND1, BRCA1, HNF1A,POU5F1, GATA4, SOX2, NUPR1ve FOXA1 genleri ileride yapılacak çalışmalaraaraştırılması gereken birer potansiyel biyobelirteç adayı olarak belirlendi. Elde ettiğimizçalışmamız non-fonksiyonel hipofiz adenomlarının tanı ve tedavisinde yol göstericiolabilir.Anahtar kelimeler: Non-fonksiyonel hipofiz adenomları, mikroarray, gen ekspresyonu

An Investigation of Non-Functioning Pituitary Adenoma Pathogenesis byTranscriptome AnalysisObjective: Approximately 25-30% of pituitary adenomas are non-functionalpituitary adenomas. Forty percent of non-functioning pitüitary adenomas are invasive.Immunohistochemical studies, molecular biology techniques and in vitro studies haveallowed more detailed classification of non-functioning adenomas. Our aim was toinvestigate the pathogenesis of non-functioning pituitary adenomas is to be investigatedat mRNA level by gene networks and pathway analysis.Method: In our study, gene expression microarray was performed in 8 normalpituitary tissues and 45 tumors samples obtained from patients with non-functioningpituitary adenomas diagnosed from Kocaeli University Faculty of MedicineNeurosurgery Department. Using IPA analysis, we identified signaling pathways andPPI (protein-protein interaction) networks to identify the key genes associated with nonfunctioningpituitary adenomas.Result: 270 up-regulated, 2428 down-regulated DEGs were identified in nonfunctioningpituitary adenoma samples compared to normal pituitary tissues. CCND1,BRCA1, HNF1A, POU5F1, GATA4, SOX2, NUPR1 ve and FOXA1.Conclusions: CCND1, BRCA1, HNF1A, POU5F1, GATA4, SOX2, NUPR1 andFOXA1 were found to have potential for use as diagnostic biomarker for nonfunctioningpituitary adenomas. Our study may shed light on the diagnosis andtreatment of non-functioning pituitary adenomas.Key Words:Non-functioning pitüitary adenomas, microarray, gene expression