dc.contributor.advisor | Kiremitçi, Abdurrahman | |
dc.contributor.author | Aydin, Emrah | |
dc.date.accessioned | 2020-12-29T11:12:50Z | |
dc.date.available | 2020-12-29T11:12:50Z | |
dc.date.submitted | 2013 | |
dc.date.issued | 2018-08-06 | |
dc.identifier.uri | https://acikbilim.yok.gov.tr/handle/20.500.12812/397599 | |
dc.description.abstract | Karbapenemler beta-laktam antibiyotikler arasında en geniş aktivitespektrumuna sahip ilaçlardır. Ancak günümüzde karbapenem dirençliEnterobacteriaeceae enfeksiyonları dünya çapında bildirilmektedir. Bu direncin esasnedeni, genetik olarak aktarılabilir karbapenemaz üretimidir. Bu çalışmada, EskişehirOsmangazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji Anabilim Dalında klinikörneklerden izole edilen ve Phoenix (BD Diagnostics, ABD) otomatize sistemi ilekarbapenem minimal inhibitör konsantrasyon (MİK) değerlerinde artış saptanan 190Enterobacteriaceae suşundan 104'ünde Etest (bioMerieux, Fransa) yöntemi ile MiKdeğerlerinde artış olduğu doğrulanmıştır. Bu suşlar üzerinde yapılan fenotipik testlerile, karbapenem direnç mekanizması olarak; 33'ünde (%31,5) `genişlemişspektrumlu beta-laktamaz (GSBL) + OXA-48 ve benzeri profil`, 26'sında (%25)OXA-48 ve benzeri profil, 18'inde (%17,5) metalo-beta-laktamaz (MBL), 13'ünde(%12,5) `KPC+MBL`, 13'ünde (%12,5) `GSBL+Porin kaybı` ve 1'inde (%1) KPCsaptanmıştır. Ayrıca Eskişehir Osmangazi Üniversitesi Tıp Fakültesinde çeşitliservislerde yatmakta olan 210 farklı hastadan alınan rektal sürüntü örnekleri 1 μg/mldozda imipenem içeren EMB agar besiyerlerine ekilmiş, izole edilen 16 suşta Etestyöntemi ile karbapenem MiK artışı olduğu doğrulanmıştır. Bu suşlar üzerindeyapılan fenotipik testler ile, karbapenem direnç mekanizması olarak; 11'inde (%5)OXA-48 ve benzeri profil, 3'ünde (%1,5) `KPC+MBL`, 2'sinde MBL (%1)mekanizması saptanmıştır. Bu çalışmaya göre; otomatize sistem sonuçlarına görekarbapenem MİK değerlerinde artış saptanan izolatlarda bu artışın doğrulanması vehastane içinde, karbapenem dirençli Enterobacteriaceae prevalansının arttığıbirimlerde karbapenem içeren besiyeri kullanılarak taşıyıcılık taraması yapılmasımantıklı görünmektedir.Anahtar Kelimeler: Enterobacteriaeceae, karbapenem direnci, karbapenema | |
dc.description.abstract | Carbapenems have the widest spectrum of activity among beta-lactam antibiotics. However, today,carbapenem resistant Enterobacteriace infections have been reported worldwide. Themain cause of this resistance is the genetic transfer of carbapenemase genes. In thisstudy, 104 of 190 Enterobacteriaeceae strains which were isolated from clinicalspecimens at Eskisehir Osmangazi University Medicine of Faculty, Department ofMicrobiology and detected as having increased MIC values by Phoenix (BDDiagnostics, USA) automated system were confirmed as having increased MICvalues by using Etest (bioMerieux, France) method. By using phenotypic methods onthese strains, the mechanisms of carbapenem resistance have been detected asfollows: At 33 strains (%31,5) as `extended spectrum beta-lactamase (ESBL) +OXA-48-like profile`, at 26 strains (%25) as OXA-48-like profile, at 18 strains(%17,5) as metallo-beta-lactamase (MBL), at 13 strains (%12,5) as `KPC+MBL`, at13 strains (%12,5) as `ESBL+Porin loss` and at 1 strain (%1) as KPC. On the otherhand, 210 rectal swabs collected from hospitalised patients at various services ofEskisehir Osmangazi University Faculty of Medicine were plated on EMB agarmedia which contain imipenem at 1 μg/ml dose for each. Sixteen of isolated strainswere confirmed as having increased carbapenem MIC values by using Etest method.By using phenotypic methods on these strains, the mechanisms of carbapenemresistance have been detected as follows: At 11 strains (%5) as OXA-48-like profile,at 3 strains (%1,5) as `KPC+MBL`, at 2 strains (%1) as MBL (%1). According tothis study, confirmation of increased carbapenem MIC values detected by automatedsystem and screening of the carriers by using carbapenem containing media at theunits that have increased carbapenem resistant Enterobacteriaceae prevalance, seemreasonable.Key Words: Enterobacteriaceae, carbapenem resistance, carbapenemase | en_US |
dc.language | Turkish | |
dc.language.iso | tr | |
dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | |
dc.rights | Attribution 4.0 United States | tr_TR |
dc.rights.uri | https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ | |
dc.subject | Mikrobiyoloji | tr_TR |
dc.subject | Microbiology | en_US |
dc.title | Enterobacteriaceae klinik izolatlarında karbapenemaz varlığının fenotipik yöntemlerle araştırılması | |
dc.title.alternative | Exploration of carbapenemase presence via phenotypic methods in clinical enterobacteriaceae isolates | |
dc.type | doctoralThesis | |
dc.date.updated | 2018-08-06 | |
dc.contributor.department | Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı | |
dc.subject.ytm | Enterobacteriaceae | |
dc.subject.ytm | Carbamazepine | |
dc.subject.ytm | Phenotype | |
dc.subject.ytm | Drug resistance | |
dc.subject.ytm | Drug resistance-microbial | |
dc.identifier.yokid | 10025216 | |
dc.publisher.institute | Tıp Fakültesi | |
dc.publisher.university | ESKİŞEHİR OSMANGAZİ ÜNİVERSİTESİ | |
dc.type.sub | medicineThesis | |
dc.identifier.thesisid | 351236 | |
dc.description.pages | 114 | |
dc.publisher.discipline | Diğer | |