Show simple item record

dc.contributor.advisorEraç, Bayrı
dc.contributor.authorDavandeh, Iskandar
dc.date.accessioned2020-12-29T08:07:25Z
dc.date.available2020-12-29T08:07:25Z
dc.date.submitted2014
dc.date.issued2018-08-06
dc.identifier.urihttps://acikbilim.yok.gov.tr/handle/20.500.12812/355428
dc.description.abstractAcinetobacter baumannii hastane kaynaklı enfeksiyonların en önemli etkenleri arasında yer almaktadır. Karbapenem grubu antibiyotikler Asinetobakter türlerinin neden olduğu enfeksiyonların tedavisinde sıklıkla kullanılmakta ve bunun sonucunda bu antibiyotiklere direnç gelişmektedir. Asinetobakter türlerinde karbapenem direncinde rol oynayan başlıca mekanizma, karbapenem hidrolize eden oksasilinazların (KHO) üretimidir. Ege Üniversitesi Hastanesi'nden izole edilen imipeneme duyarlı olmayan 76 A. baumannii izolatının imipenem Minimum İnhibitör Konsantrasyon (MİK) değerleri mikrodilüsyon yöntemi ile belirlenmiştir. Bu izolatlarının klonal ilişkileri ERIC (Enterobacterial Repetitive İntergenic Consensus)-PCR yöntemi ile değerlendirilmiş ve başlıca KHO gruplarının (OXA-23-grup; OXA-24-grup; OXA-51-grup ve OXA-58-grup) varlığı multipleks PCR tekniği ile araştırılmıştır. Çalışmamız kapsamında incelenen A. baumannii izolatlarının ERIC-PCR paternlerine göre 13 farklı klona ayrıldığı gözlenmiştir. Bunlardan A klonu üç subtip ve 40 üyesi ile en büyük klon olurken, B klonunun 9, C klonunun 14, G, K ve L klonlarının ikişer üyesi olduğu saptanmışdır. Ayrıca tek üyeli 7 klon (D, E, F, H, I, J ve M) tespit edilmiştir. Tüm klonların temsilcilerinde blaOXA-51-grup belirlenmiş, blaOXA-23-grup ise K ve L klonları dışındaki diğer klonlarda gözlenmiştir. BlaOXA-58-grup sadece K ve L klonlarına ait dört izolatta bulunurken, incelenen hiçbir kökende blaOXA-24-grup'a rastlanmamıştır. Moleküler tiplendirme sonuçları, çalışmaya alınan imipenem dirençli A. baumannii kökenlerinin çoğunun klonal olarak ilişkili olduğunu ortaya koymuştur. Tüm klon temsilcilerinde blaOXA-51-grup ve iki küçük klon dışındaki diğer klonlarda blaOXA-23-grup saptanmış olması, incelenen A. baumannii kökenlerindeki İMP direncinden çoğunlukla bu iki KHO grubunun sorumlu olduğunu göstermektedir. Çalışmamızda ayrıca iki küçük klonun üyesi olan dört kökende blaOXA-58-grup varlığı da gösterilmiştir.
dc.description.abstractAcinetobacter baumannii is an important causative agent of nosocomial infections. Carbapenems have been frequently used in the treatment of infections caused by Acinetobacter spp., and as a result, resistance has been developed to these antibiotics. The primary mechanism involved in carbapenem resistance in Acinetobacter spp. is the production of carbapenem-hydrolysing oxacillinases (CHO). Minimum inhibitory concentration (MIC) values of 76 imipenem non-susceptible A. baumannii strains isolated from Ege University Hospital were determined by microdilution method. The clonal relationship of the isolates was analyzed by `Enterobacterial repetitive intergenic consensus` (ERIC)-PCR and the presence of CHO major groups (OXA-23; OXA-24; OXA-51 and OXA-58 groups) was investigated by multiplex PCR technique. According to ERIC-PCR patterns, A. baumannii isolates examined in our study were distributed in 13 different clones. Clone A was the largest clone with three subtypes and 40 members. Clone B and clone C included, 9 and 14 members, respectively. Clone G, K and L had two members each. Additionally, seven clones (D, E, F, H, I, J and M) included only one member each, were detected. BlaOXA-51-group was found in representatives of all the clones, blaOXA-23-group was observed in representatives of all clones other than the clone K and L. While blaOXA-58-group was detected only in four members of clone K and L, blaOXA-24-group was not encountered in any of the examined strains. Molecular fingerprinting revealed that most of the imipenem resistant A. baumannii strains were clonally related. Detection of blaOXA-51-group in representatives of all clones and blaOXA-23-group in representatives of all but two small clones indicated that, these two CHO were mostly responsible for the imipenem resistance of the examined A. baumannii strains. In our study, the presence of blaOXA-58-grup was also shown in four strains which were the members of two small clones.en_US
dc.languageTurkish
dc.language.isotr
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rightsAttribution 4.0 United Statestr_TR
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.subjectKlinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıklarıtr_TR
dc.subjectClinical Microbiology and Infectious Diseasesen_US
dc.titleKlinik acınetobacter baumannıı izolatlarında karbapenem direncine yol açan sınıf-D beta-laktamazların araştırılması
dc.title.alternativeInvestigation of class-D beta-lactamases causing carbapenem resistance in clinical acinetobacter baumannii isolates
dc.typemasterThesis
dc.date.updated2018-08-06
dc.contributor.departmentFarmasötik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı
dc.subject.ytmAcinetobacter
dc.subject.ytmAcinetobacter baumannii
dc.subject.ytmCarbapenems
dc.subject.ytmBeta lactamases
dc.subject.ytmPolymerase chain reaction
dc.subject.ytmOxacillin
dc.identifier.yokid10030566
dc.publisher.instituteSağlık Bilimleri Enstitüsü
dc.publisher.universityEGE ÜNİVERSİTESİ
dc.identifier.thesisid399041
dc.description.pages82
dc.publisher.disciplineDiğer


Files in this item

Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

info:eu-repo/semantics/openAccess
Except where otherwise noted, this item's license is described as info:eu-repo/semantics/openAccess