Show simple item record

dc.contributor.advisorÖnen Bayram, Filiz Esra
dc.contributor.authorAlradhwani, Sarah Ardam Abdulqader
dc.date.accessioned2020-12-29T06:58:19Z
dc.date.available2020-12-29T06:58:19Z
dc.date.submitted2018
dc.date.issued2019-08-19
dc.identifier.urihttps://acikbilim.yok.gov.tr/handle/20.500.12812/340091
dc.description.abstractGünümüzde birçok çalışma depresyon ile enflamasyon hastalıklarını ilişkilendirmekte ve bu bağlantının temelini oluşturan mekanizmaları aydınlatmaktadır. Ayrıca aynı anda seyredebilen bu iki hastalığın tedavi stratejilerinde antienflamatuvar (AI) ve antidepresan (AD) moleküllerinin beraber kullanılması da önerilmektedir. Ancak, bildiğimiz kadarıyla, bu iki hastalığın tedavisinde kullanılan bileşiklerin yapılarının benzerliğini araştıran bir çalışma henüz gerçekleştirilmemiştir. Bu nedenle, bu çalışma AI ve AD bileşiklerinin yapı benzerliklerinin bilgisayar ortamında araştırmayı hedeflemektedir. Çalışmada kullanılacak yapılar Clarivates Analytics veritabanı (Web of Science) 2008-2017 aralığında taranarak elde edilmiştir. Elde edilen yapıların benzerlikleri önce manüel olarak daha sonra da bilgisayar ortamında cosine ve Tanimoto katsayıları hesaplanarak belirlenmiştir. Çalışma yapısal benzerlik gösteren birçok molekül ortaya çıkarmış ve bunlardan özellikle ikisinin olduça yakın yapıda olduklarını saptamıştır. Benzer bulunan yapılar KMUP-1 olarak da bilinen 7-{2-[4-(2-klorofenil)piperazin-1-il]butil}-1,3-dimetilpürin-2,6-dion (AI8) ve 7-{4-[4-(3-klorofenil)piperazin-1-il]butil}-1,3-dimetilpürin-2,6-diondur (AD10) 96% benzerlik gösterdi. Çalışma ayrıca AD16 ve AD17 kumarin türevlerinin de AI12 türeviyle %80 oranında yapı benzerliği gösterdiğini ortaya koymuştur.Anahtar Kelimeler: antidepresan, antienflamatuvar, yapı, benzerlik, komorbid hastalık
dc.description.abstractCurrently many studies link depression to inflammation and mechanism that underlie this connection are being elucidated. Also new treatment strategies for these comorbid diseases that combine the use of antidepressants (AD) with anti-inflammatory agents (AI) are being suggested. However, to the best of our knowledge, no study yet investigated the structural similarity of the compounds used to treat these two diseases. Thus, in this study we examined whether there is any structural similarity between AD and AI molecules in silico. We gathered from the literature the AI and AD derivatives using Clarivates Analytics database (Web of Science) and we covered the period from 2008-2017. Then we did a manual search and obtained the most similar structures. In order to be able to discuss our results we also used computational methods and measured the similarity of the compounds using the cosine and Tanimoto similarity coefficients. By this method, we found 12 similar structures two of these, which are 7-{2-[4-(2-chlorophenyl)piperazin-1-yl]ethyl}-1,3-dimethylpurine-2,6-dione known as (KMUP-1) (AI8), and 7-{4-[4-(3-chlorophenyl)piperazin-1-yl]butyl}-1,3-dimethylpurine-2,6-dione (AD10), their similarity was 96%. We found also that the coumarin derivatives AD16 and AD17 are 80% similar to the compound AI12.Keywords: antidepressant, anti-inflammatory, structure, similarity, comorbid diseasesen_US
dc.languageEnglish
dc.language.isoen
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rightsAttribution 4.0 United Statestr_TR
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.subjectEczacılık ve Farmakolojitr_TR
dc.subjectPharmacy and Pharmacologyen_US
dc.titleThe analysis of the structural similarity of some antidepressants and anti-inflammatory molecules
dc.title.alternativeBazı antidepresan ve antienflamatuvar moleküllerin yapı benzerliklerinin tayini
dc.typemasterThesis
dc.date.updated2019-08-19
dc.contributor.departmentFarmasötik Kimya Anabilim Dalı
dc.subject.ytmAnti inflammatory agents
dc.subject.ytmMolecular structure
dc.subject.ytmComorbidity
dc.subject.ytmDepression
dc.subject.ytmInflammation
dc.subject.ytmAntidepressive agents
dc.identifier.yokid10224497
dc.publisher.instituteSağlık Bilimleri Enstitüsü
dc.publisher.universityYEDİTEPE ÜNİVERSİTESİ
dc.identifier.thesisid535885
dc.description.pages87
dc.publisher.disciplineDiğer


Files in this item

Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

info:eu-repo/semantics/openAccess
Except where otherwise noted, this item's license is described as info:eu-repo/semantics/openAccess