Show simple item record

dc.contributor.advisorTelci Temeltaş, Dilek
dc.contributor.authorİlter Akülke, Ayca Zeynep
dc.date.accessioned2020-12-29T06:45:34Z
dc.date.available2020-12-29T06:45:34Z
dc.date.submitted2016
dc.date.issued2018-08-06
dc.identifier.urihttps://acikbilim.yok.gov.tr/handle/20.500.12812/338680
dc.description.abstractKanser hücrelerinin kontrolsüz migrasyonu sırasında hücre adhezyonu ve hücre iskeleti dinamikleri integrinler tarafından kontrol edilmektedir. Doku transglutaminazı (dTG), transglutaminazlar arasında dokularda en yaygın ifade edilen protein olmakla beraber dTG, Ca+2 varlığında proteinler arasında ε-(γ-glutamil)-lisin izopeptidi oluşturarak proteinler arası çapraz bağ kurduğu bilinmektedir. Son yapılan çalışmalar göstermiştir ki ileri renal hücreli böbrek kanseri (RHBK) tümörlerinde dTG seviyesi, ITGβ1 ve SDC4 proteinleri ile beraber artmakta bu nedenle kemoterapiye dirençli olan RHBK için yeni bir teröpatik markör olarak öne sürülmektedir. RHBK tedavisinde integrine spesifik tedavi ajanlarının yetkin etki göstermemesi dTG'nin sindekan-4 (SDC4) ile birlikte β1 integrinlerin hücre içine alımı ve dışarı çıkarılması mekanizmasında rol oynadığını öne sürmüş ve bu tezin hipotezini oluşturmuştur. Bu sebeple RHBK hücre hatlarında dTG ve ITGβ1&SDC4 arasındaki interaksiyon immün çökertme metodu ile belirlenmiş olup dTG ifadesi azaltılmış RHBK hücrelerinin β1 integrin matrislerine yapışma ve yayılma potansiyelleri incelenmiştir. dTG ve SDC4'ün ITGβ1'lerin hücre içine alınması belirlemek için hücre yüzeyindeki ITGβ1'ler biyotinlenerek immün çökerme uygulanmış; ITGβ1'lerin dışarı verilmesindeki rolünün belirlenmesi için ise ITGβ1'e özgü antikor ile etiketlenen integrinlerin hücre yüzeyi seviyesi akış sitometresi ile yapılmıştır. dTG seviyesi azalmış RHBK hücrelerinin integrin β1 matrislerine yapışması ve yayılmasında önemli ölçüde azalma bulunarak dTG' nin hücre adhezyonundaki görevi tespit edilmiştir. İncelenen dört farklı RHBK hücre hattından dTG ile ITGβ1 ve SDC-4 etkileşiminin Caki-1 metastatik hücre hattında en yüksek düzeyde olduğu bulunmuştur; bu nedenle shRNA teknolojisi ile dTG ve SDC4 proteinleri baskılanarak β1 integrinlerinin hücre içine alınması ve dışarı çıkması döngüsündeki rolü Caki-1 hücre hattında tespit edilmiştir. Sonuçlarımız ışığında dTG' nin SDC4 ile ITGβ1'nin hücre yüzeyindeki deviniminde rol oynadığı tespit edilerek RHBK metastazı nedeni olan hücre göçünde önemli rol oynayabileceği ortaya atılmıştır
dc.description.abstractIntegrins plays an important role in metastasis formation by orchestrating the cell adhesion and cytoskeletal dynamics together with the surrounding extracellular matrix. Tissue transglutaminase (TG2) is the ubiquitously expressed member of transglutaminase family which is able to catalyze Ca+2 dependent cross-linking by forming an intermolecular ε-(γ-glutamyl)-lysine isopeptide bond between proteins. Recent study demonstrated that regardless from its enzymatic activity, the upregulation of TG2 along with ITGβ1 and SDC4 can be a new diagnostic marker in the metastatic state of renal cell carcinoma (RCC), a notoriously radio-resistant and chemoresistant cancer. To date, integrin targeted therapeutic agents is not able to stabilize the metastatic progress of RCC therefore this study seeks to understand whether TG2 together with SDC4 may behave as a central player during the endo/exocytic cycle of β1 integrins. For this purpose, crosstalk between TG2 and cell surface receptors SDC4, ITGβ1 was investigated in RCC cell lines using co-immunoprecipitation (IP) assay followed by the measurement of cell attachment and spreading potential of TG2 downregulated RCC cells on β1 integrin substrates. In order to clarify the role of TG2-SDC4 interplay in integrin internalization and recycling a biotinylation-based IP and Flow Cytometry assay using active integrin binding antibody was performed, respectively. Results from this study showed that TG2 was associated with ITGβ1&SDC4 in all four primary and metastatic site RCC cell lines with the highest interaction affinity detected for the metastatic Caki-1 cells. Cell adhesion assays suggested that TG2 is a major component that mediates the RCC cell adhesion as the silencing of TG2 in all four RCC cell lines resulted in a marked decrease in their adhesion potential on β1 integrin substrates. The analysis of the role of TG2 and SDC4 in integrin β1 trafficking in Caki-1 cells using shRNA technology suggested that TG2 together with SDC4 contributes to the β1 integrin internalization and recycling. These findings support a role for TG2 in association with SDC4 in the development of RCC metastases through regulation of the cell adhesion and β1 integrin trafficking.en_US
dc.languageEnglish
dc.language.isoen
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rightsAttribution 4.0 United Statestr_TR
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.subjectBiyolojitr_TR
dc.subjectBiologyen_US
dc.subjectBiyoteknolojitr_TR
dc.subjectBiotechnologyen_US
dc.titleRole of tissue transglutaminase induced integrin trafficking in kidney cancer metastasis
dc.title.alternativeDoku transglutamınaz güdümlü integrin trafiğinin böbrek kanseri metastazı üzerine etkisi
dc.typedoctoralThesis
dc.date.updated2018-08-06
dc.contributor.departmentBiyoteknoloji Anabilim Dalı
dc.identifier.yokid10112651
dc.publisher.instituteFen Bilimleri Enstitüsü
dc.publisher.universityYEDİTEPE ÜNİVERSİTESİ
dc.identifier.thesisid438706
dc.description.pages185
dc.publisher.disciplineDiğer


Files in this item

Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

info:eu-repo/semantics/openAccess
Except where otherwise noted, this item's license is described as info:eu-repo/semantics/openAccess