Age-dependent effects of short-term intermittent fasting and rapamycin treatment in zebrafish (danio rerio) brain
dc.contributor.advisor | Adams, Mıchelle Marıe | |
dc.contributor.author | Çelebi Birand, Ergül Dilan | |
dc.date.accessioned | 2020-12-02T12:25:45Z | |
dc.date.available | 2020-12-02T12:25:45Z | |
dc.date.submitted | 2020 | |
dc.date.issued | 2020-11-04 | |
dc.identifier.uri | https://acikbilim.yok.gov.tr/handle/20.500.12812/32964 | |
dc.description.abstract | Dünya nüfusu hızla yaşlanmaktadır ve sağlık durumunda yaşa bağlı gerilemenin engellenmesini veya geriye çevrilmesini sağlayacak müdahalelerin geliştirilmesine ivedi ihtiyaç duyulmaktadır. Şimdiye kadar sağlıklı yaşam süresini uzatmaya yönelik çeşitli yaklaşımlar geliştirilmiştir. Bu yaklaşımlar arasında genetik tabanlı olmayan müdahaleler, insanlarda uygulanabilirlik açısından daha yüksek bir potansiyele sahiptir. Kalori kısıtlaması (KK) ve KK'nın farmakolojik mimetiği rapamisin, farklı canlı türlerinde yaşam ve sağlıklı yaşam süresini güvenilir bir şekilde uzattığı gösterilen uygulamalardır. KK ve rapamisinin yararlı etkilerini nasıl gösterdiğine dair artmakta olan bilgiye rağmen bunların beyindeki moleküler mekanizmaları henüz tam olarak anlaşılabilmiş değildir. Dahası birçok çalışma, insanlarda yapılacak çalışmalar için elverişli olmayan bir yaklaşım olan yaşam boyu KK uygulamasını incelemiştir. Bu boşluğu doldurmak için bir KK yaklaşımı olan aralı oruç (AO) ve rapamisinin kısa süreli uygulamalarının beyindeki kritik işlemlerin hücresel ve moleküler belirteçleri ile vücuttaki metabolik parametreleri değiştirme durumunu inceledik. Deneklerin yaşının tedavi sonucunu nasıl etkilediğini değerlendirmek için yakın zamanda gerontoloji çalışmalarında uygun bir model olarak ortaya çıkan zebra balıklarının genç (6-10 aylık) ve yaşlı (26-31 aylık) bireylerini çalışmamıza dahil ettik. Bulgularımız, AO uygulamasının genç ve yaşlı hayvanlarda tüm vücut glikoz ve kortizol seviyelerini düşürdüğünü, nöral progenitör hücre belirteci DCAMKL1'i ise artırdığını göstermiştir. Genç hayvanlarda bu çoğalma destekleyici etkinin önünde mTOR aktivitesinin baskılanması yer alırken yaşlı hayvanlarda foxm1 ifadesinin arttığı ve LC3-II/LC3-I oranı ile ölçülen otofajik akının azaldığı gözlemlenmiştir. Diğer tarafta rapamisin, metabolik parametreleri değiştirmemiş, genç ve yaşlı hayvanlarda tamamen farklı moleküler profillere sebep olmuştur. Genç hayvanlarda en kayda değer değişimler mTOR aktivitesi, LC3-II/LC3-I oranı ve geniş çaplı hücre çoğalması belirteci olan PCNA ifadesindeki azalmalar olmuştur. Yaşlı hayvanlarda ise etkinleştirilmiş astrosit belirteci (GFAP) seviyeleri düşmüş, bu durum nöroinflamasyonun azaldığını işaret etmiştir. Ayrıca PSD-95/Gephyrin oranı ile ölçülen eksitatör-inhibitör iletim dengesi eksitatör duruma kaymıştır. Bu bulgular, AO ve rapamisinin genç ve yaşlı hayvanlarda farklı metabolik profillere sebep olduğunu göstermiştir. Dahası hücre çoğalması ve otofaji arasında yaşa bağlı bir karşılıklı ilişki görülmüştür. Bu ilişkinin mTOR aktivitesinin ayrışık düzenlenmesine kısmen bağlı olması muhtemeldir. İlginç bir şekilde rapamisin muamelesi, mTOR aktivitesini baskılama konusunda genç hayvanlarda ve AO uygulamasına göre daha etkili olmuştur. Bununla birlikte elde edilen bulgular, rapamisinin zebra balığında kan-beyin bariyerini geçtiğini ve kısa süreli AO ve rapamisin uygulamalarının beyindeki kritik mekanizmalarda görevli anahtar proteinlerin ifade seviyelerini değiştirmeye yeterli olduğunu göstermiştir. | |
dc.description.abstract | World populations are rapidly aging, and there is an urgent need to develop interventions that prevent or reverse age-related deterioration of health. To date, several approaches have been developed to extend health span. Among these, non-genetic interventions have a higher potential to be utilized in translational studies. Caloric restriction (CR) and its pharmacological mimetic rapamycin, are two applications that have been shown to reliably extend life and health span across species. Despite a growing body of knowledge on how CR and rapamycin show their beneficial effects, their molecular mechanisms in the brain are not completely understood. Furthermore, most studies applied life-long CR, which is not suitable for translational research. To fill this gap, we investigated whether short-term durations of a CR approach intermittent fasting (IF) or rapamycin altered cellular and molecular markers of critical processes in the brain as well as metabolic parameters in the body. To assess how the age of the subjects affect the outcome of the treatments, we included young (6-10 months old) and old (26-31 months) zebrafish, which has recently emerged as a suitable model for gerontological research. Our results demonstrated that IF decreased whole-body glucose and cortisol levels, and increased neural progenitor marker DCAMKL1 in young and old animals. While this proliferation-promoting effect was preceded by suppression of mTOR activity in young, the upregulation of foxm1 and reduced autophagic flux as measured by LC3-II/LC3-I ratio were observed in old animals. Rapamycin, on the other hand, did not alter the metabolic parameters and induced entirely different molecular profiles at young and old ages. The most notable changes in young animals were reduced mTOR activity, LC3-II/LC3-I ratio and expression levels of a global proliferation marker PCNA. In old animals, the marker of activated astrocytes (i.e. GFAP) was decreased, indicating lower neuroinflammation, whereas excitatory-inhibitory balance as measured by PSD-95/Gephyrin ratio was shifted towards a more excitatory state. These results suggested that IF and rapamycin induced distinct metabolic profiles in young and old animals. Furthermore, there was an age-dependent reciprocal relationship between proliferation and autophagy, which might be partly due to differential regulation of mTOR activity. Interestingly, rapamycin treatment was more effective in suppressing mTOR activity in young animals, and compared to IF. Nevertheless, these results suggested that rapamycin crosses the blood-brain barrier in zebrafish, and that short-term durations of IF or rapamycin were sufficient to alter the expression levels of key proteins involved in critical mechanisms in the brain. | en_US |
dc.language | English | |
dc.language.iso | en | |
dc.rights | info:eu-repo/semantics/embargoedAccess | |
dc.rights | Attribution 4.0 United States | tr_TR |
dc.rights.uri | https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ | |
dc.subject | Biyoloji | tr_TR |
dc.subject | Biology | en_US |
dc.subject | Nöroloji | tr_TR |
dc.subject | Neurology | en_US |
dc.title | Age-dependent effects of short-term intermittent fasting and rapamycin treatment in zebrafish (danio rerio) brain | |
dc.title.alternative | Kısa süreli aralı oruç ve rapamisin uygulamalarının zebra balığı (danio rerio) beynindeki yaşa bağlı etkileri | |
dc.type | doctoralThesis | |
dc.date.updated | 2020-11-04 | |
dc.contributor.department | Nörobilim Anabilim Dalı | |
dc.identifier.yokid | 10335968 | |
dc.publisher.institute | Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü | |
dc.publisher.university | İHSAN DOĞRAMACI BİLKENT ÜNİVERSİTESİ | |
dc.identifier.thesisid | 628614 | |
dc.description.pages | 173 | |
dc.publisher.discipline | Diğer |