Meme/over kanseri ailelerinde BRCA1/BRCA2 dışı genlerin hastalık riskine etkisinin araştırılması

Abstract

Meme kanseri Türkiye'de ve dünyada kadınlar arasında en sık görülenmalignensidir. Mame kanseri dünya çapında kadınlar arasında her yıl 40.000 ölüme nedenolur. Meme kanseri kompleks ve çok faktörlü bir hastalıktır. Meme kanserlerinin yaklaşık% 5-% 10'nu kalıtsaldır. Kalıtsal meme kanserinin %15-20'sinden BRCA1/2 genlerininmutasyonları sorumludur. BRCA1/2 gen mutasyonları Türk toplumunda kalıtsal memekanserinin %10'undan daha azını oluşturmaktadır. Bu sebeple BRCA1/2 genleri dışındameme kanseri yatkınlık genlerinin rolünün incelemesi gereklidir. Farklı meme kanseriyatkınlık genleri arasında P53, PTEN ve CHEK2 genleri daha fazla ön plana çıkmaktadır.Bir çok çalışmaya göre bu genler meme kanseri riskini arttırmaktadır, hatta bazen tedavisonuçlarını da etkileyebilmektedir.Bu çalışmaya BRCA1/2 mutasyonuna shahip olmayan ve aile hikayesi güçlü olanmeme kanseri tanısı almış12 birey dahil edilmiştir. Genomik DNA, periferal kandan izoleedilmiştir. P53 ve PTEN genlerinde hotspot bölgeleri içeren ekzonlar (PTEN için: 2., 3., 5.,6., 7. ve 8. Ekzonları ve P53 için, 4., 5., 6., 7., 8. ve 9. ekzonları) amplifiye edildi. CHEK2geni ise bütün kodlayıcı ekzonlar ( ekzon 2-ekzon 15 ) amplifiye edildi. PCR ile amplifiyeedilmiş ekzonlar otomatik kapiler jel elektroforezi ile dizileme cihazı ile dizileri okundu vemutasyon ya da değişim açıdan kontrol edildi.Çalışmanın sonucunda 12 hastanın tümünün P53 geninde c.215C > G(p.Pro72Arg) polimorfizmin 12 olgudan birinde homozigot oalarak, P53 geninde 6.ekzonunda c.638G > A (p.Arg213Gln) mutasyonu heterozigot olarak bulunmuştur. Onikiolgunun tümünde PTEN geninde c.802-4_802-3delTTdelesyonu heterozigot olaraksaptanmıştır. CHEK2 geninde ise bir olguda c.470T (p.I157T) mutasyonu heterozigotolarak bulunmuştur.Sonuç olarak Türk popülasyonunda P53 c.215C>G (p.Pro72Arg) ve c.638G > A(p.Arg213Gln) , PTEN c.802-4_802-3delTT ve CHEK2 c.470T>C (p.I157T) değişiklikleri ,meme kanserin riskini etkileyebilmektedir. Ama bu değişimlerin frekansları , memekanserinin üzerindeki etkisi ve meme kanserinin riskini ne kadar etkilediğinin bilinebilmesiiçin daha fazla çalışmalara ihtiyaç vardır .Anahtar Kelimeler: Meme Kanseri, P53 Gen , PTEN Gen, CHEK2 Gen, PCR,DNA Dizileme, Mutasyon

Breast cancer is the most common malignancy in Turkey and worldwide. Breastcancer is a complex and multifactorial disease. Approximately 5%-10% of breast cancersare hereditary. Almost 15%-20% of the hereditary breast cancer is attributed to BRCA1/2,mutations. In Turkish population BRCA1/2 mutations compose less than 10% of thehereditary breast cancer. For this reason studying the role of breast cancer susceptibilitygenes, in additon to BRCA1/2 is necessary. Among different breast cancer susceptibilitygenes P53, PTEN and CHEK2 are more stressed. Many studies have demonstrated thatmutations in these genes are related to the breast cancer and influence therapy outcomes, insome cases.In this study, 12 non- BRCA1/2 Turkish patients whose pedigrees are strong andsuggestive were chosen. Genomic DNA samples were isolated from peripheral blood. InP53 and PTEN genes, exons containing mutation hotspots amplified by PCR, exons 2, 3, 5,6, 7 and 8 in PTEN gene and exons 4, 5, 6, 7, 8 and 9 in P53 gene. In the case of CHEK2gene whole coding exons (1-14) were amplified by PCR. All amplified exons weresequenced by capillary gel electrophoresis and screened for any possible mutation.As a result all of the 12 patients harbor a c.215C>G (p.Pro72Arg) polymorphism ashomozygot in their P53 gene. In 1 out of 12 patient a c.638G>A (p.Arg213Gln) mutation asheterozygot in exon 6 of its P53 gene was detected. All patients carry a c.802-4_802-3delTT deletion as heterozygot in their PTEN gene.In 1 out of the 12 patients c.470T>C(p.I157T) heterozygot mutation in the CHEK2 gene was found.In conculusion, in Turkish population P53 gene c.215C>G (p.Pro72Arg) andc.638G>A (p.Arg213Gln), PTEN gene c.802-4_802-3delTT and CHEK2 gene c.470T>C(p.I157T) changes may take part in increasing breast cancer risk. But specifying theirfrequency, their amount of influence on breast cancer in Turkish population and on therapyneed more studies.Keywords: Breast cancer, P53 Gene, PTEN Gene, CHEK2 Gene, PCR,DNA Sequencing, Mutation.