dc.contributor.advisor | Efendioğlu, Mustafa | |
dc.contributor.author | Efendioğlu, Mustafa | |
dc.date.accessioned | 2020-12-10T12:36:31Z | |
dc.date.available | 2020-12-10T12:36:31Z | |
dc.date.submitted | 2009 | |
dc.date.issued | 2019-04-09 | |
dc.identifier.uri | https://acikbilim.yok.gov.tr/handle/20.500.12812/290447 | |
dc.description.abstract | MMP enzimlerinin tümör hücrelerinde fazla sentezlenmesi ve hücre dışı matriksinyıkılması tümör hücrelerinin hareketlilik kazanması açısından önemlidir. MMP-1 genekspresyonu, promoterindeki bağlanma bölgelerine bağlanan aktivatör protein-1 (AP-1)ve polima güçlendirici aktivite-3 (PEA-3/ETS) vasıtasıyla mitojen aktive edici kinaztarafından kontrol edilir. MMP-1 geni promoter bölgesinin -1607 bç'sinde meydana gelenguanin insersiyonu ile yeni bir ETS bağlanma bölgesi oluşur. Buna bağlı olarakta MMP-1geninin transkripsiyonel aktivitesi artar. Çalışmamızdaki amaç menengiomalı olgulardaMMP-1 geni promoter bölge polimorfizmin tespitini ve bunun insidans ve invazyondakirolünü araştırmaktır.Yapılan araştırma 2006-2008 tarihleri arasında kliniğimizde ameliyat edilmiş, yaşları 9 ile83 arasında değişmekte olan, 20'si kadın ve 13'ü erkek olmak üzere toplam 33 olgununbiopsi örnekleri -80C derecede DNA izolasyonu yapılana kadar saklandı. Olgularınortalama yaşları 52.63±16.23'tür. Çalışmaya 66 sağlıklı olgu dahil edilmiştir. Olgularınhistopatolojik dağılımına bakıldığında, 19'u transizyonel tip, 6'sı meningothelial tip, 4'üatipik tip, 2'si fibröz tip ve 2'si de psammatöz tip olduğu görülmüştür. Olguların dokubiobsilerinden izole edilen DNA örnekleri seçilen primerler vasıtasıyla PZR işlemine tabitutulup MMP-1 geni promoter bölgesini içeren kısım termal döngü cihazı ileçoğaltılmıştır. Elde edilen amplikonların guanin bazı insersiyonuna bağlı olarak ALU Ienzimi ile genotipleme yapılıp agaroz jel elektroforez işlemine tabi tutularak ethidiumbromid sayesinde UV ışık altında görüntülenmiştir. Buna bağlı olarak guanin bazınıninsersiyonu olması durumunda ALU I enzimi amplikonda herhangi bir kesim bölgesiolmayacağından amplikonlar kesilmeyip bir bütün olarak kalmıştır. Fakat insersiyonunolmadığı durumda ALU I enzimi mevcut amplikonu 162 bç ve 28 bç uzunluğunda ikiparçaya ayırmıştır.Sonuç olarak olguların 10'unda I/I (%30.3), 9'unda D/ D (%27.3), 14'ünde I/ D (42.4)genotipi tespit edilmiştir. Genotipi I/I olan olguların 4'ü transisyonel, 2'si psammomatöz,2'si fibröz, 2'si atipik, genotipi D/D olan olguların 8'i transisyonel, 1'i atipik, genotipi I/Dolan olguların ise 8'i transisyonel, 5'i meningotelial,1'i atipik olarak tespit edildi. Kontrolgrubunda ise 27'sinde I/I (%40.9), 18'inde D/D (%27.3), 21'inde I/D (31.8) olarak tespitedilmiştir. Meningiomalı hastalarda genotip dağılımı kontrol grubundan belirgin farkgöstermemiştir (p> 0.05).MMP-1 geni promoter bölgesinde meydana gelen Guanin insersiyonunun varlığı akciğerkanseri, over kanseri, nazofaringeal karsinoma ve meme kanseri riskini artırmakla berabergastrik kardiak adenokarsinom ve özefagus squamöz hücreli karsinomda etkisininolmadığı görülmüştür. Bizim çalışmamızın sonuçları da MMP-1 geni promoterbölgesinde meydana gelen Guanin insersiyonunun menengioma sıklığını ve invazyonunuetkilemediğini düşündürmektedir. | |
dc.description.abstract | Introduction: Increased production of MMP enzymes in tumor cells and destruction ofextracellular matrix promote tumor cell mobility. The aim of this study is to determine thepolymorphism in the MMP-1 gene promoter region in patients with meningioma and toassess the role of this polymorphism in invasion.Methods: The study group involved 33 patients (age: 52.63 + 16.23 (range: 9-83); 13males and 20 females) who had surgery in our clinic between 2006 and 2008. The biopsysamples are frozen in -80 C and DNA isolation is performed. A total of 66 healthyindividuals are included in the study. The meningioma types were as follows: 19transitional, 6 meningiothelial, 4 atypical, 2 fibrous, and 2 psammomatous. PZR wasperformed in the DNA samples. Genotyping was done with ALU1 enzyme and agarosegel electrophoresis was conducted for visualization.Results: The determined genotypes were as follows: I/I in 10 (% 30.3), D/D in 9 (%27.3),I/D in 14 (%42.4). Among the I/I genotypes, 4 were transitional, 2 were psammomatous,2 were fibrous, and 2 were atypical. Among the D/D genotypes, 8 were transitional, and 1was atypical. Among the I/D genotypes 8 were transitional, 5 were meningiothelial, and 1was atypical. The control group genotypes were as follows: I/I in 27 (%40.9), D/D in 18(%27.3), and I/D in 21 (%31.3). The genotype distribution was not significantly differentin the study group when compared to the control group (p > 0.05).Conclusions: The effect of matrix MMP-1 gene promoter region polymorphism on therisk of various cancer types (ovarian, pulmonary, breast, esophagus, gastricadenocarcinomas, nasopharengeal cancer, and oral squamous cell carcinoma) waspreviously studied. This polymorphism was shown to increase the risk of certain cancertypes while not having any impact on some others. According to this study`s results,MMP-1 gene promoter region polymorphism does not seem to effect neither theincidence nor the invasion of meningioma. | en_US |
dc.language | Turkish | |
dc.language.iso | tr | |
dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | |
dc.rights | Attribution 4.0 United States | tr_TR |
dc.rights.uri | https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ | |
dc.subject | Nöroşirürji | tr_TR |
dc.subject | Neurosurgery | en_US |
dc.title | Menengiomalı hastalarda matriks metalloproteinaz 1 genipromotor bölge polimorfizminin sıklık ve invazyondaki rolünün incelenmesi | |
dc.title.alternative | The role of a single nucleotide polymorphism of thematrix metalloproteinase-1 gene promoter regionin invasion and prognosis of meningiomas | |
dc.type | doctoralThesis | |
dc.date.updated | 2019-04-09 | |
dc.contributor.department | Nöroşirürji Anabilim Dalı | |
dc.identifier.yokid | 10243710 | |
dc.publisher.institute | Göztepe Eğitim ve Araştırma Hastanesi | |
dc.publisher.university | DİĞER (KURUMLAR, HASTANELER VB.) | |
dc.type.sub | medicineThesis | |
dc.identifier.thesisid | 537777 | |
dc.description.pages | 88 | |
dc.publisher.discipline | Diğer | |