Türkiyede inflamatuar romatizmal hastalıklarda PTPN22 gen polimorfizmi varlığı

Abstract

Giriş: Lenfoid tirozin fosfataz proteinini kodlayan PTPN22 geninde saptananfonksiyonel tek nükleotid polimorfizminin romatoid artrit (RA) ve tip 1 diabetesmellitus (DM) gibi otoimmün hastalıklara yatkınlık ile ilişkili olduğugösterilmiştir. Lenfoid tirozin fosfatazın T hücrelerinin aktivasyonunda roloynayan kinazlarla etkileştiği ve polimorfizmin bu etkileşimi aşırı yanıtlılıkyönünde değiştirdiği düşünülmektedir. PTPN22 R620W farklıpopülasyonlarda farklı alel frekanslarına sahiptir ve en yüksek frekansİskandinav ülkelerinde görülürken, Asya ve Afrika topluluklarında seyreksaptanmıştır. Bu araştırmada Türkiye'de RA, Takayasu arteriti (TA) veBehçet Hastalığı' nın (BH) PTPN22 R620W polimorfizmi ile ilişkisiaraştırılmıştır.Gereç-Yöntem: Çalışma kapsamında RA'lı 167 hasta (25 erkek/142 kadın,ortalama yaş: 52.1±11.7), TA'lı 181 hasta (19 erkek/162 kadın, ort. yaş:37±11.7), BH'lı 134 hasta (71 erkek/63 kadın, ort. yaş: 32.8±9.7) ve 177sağlıklı kontrol (86 erkek/91 kadın, ort. yaş: 40.6 ± 9.7) yer aldı. PTPN22 genpolimorfizmi (rs2476601, A/G) PCR-RFLP yöntemi ile genotiplendirildi.Polimorfik bölge PCR ile çoğaltılıp XcmI enzimi ile parçalandı. Genotipdağılımları gruplar arasında k-kare ile karşılaştırıldı.Bulgular: Heterozigot genotip (AG) frekansı kontrol grubunda % 5.1 (9/177),RA' da % 6.6 (11/167) ve TA' da % 3.8 (7/181) olarak saptandı. RA, TA vekontrol grupları arasında istatistiksel olarak anlamlı fark saptanmadı (RA: p=0.55, OR: 1.3, 95% CI: 0.53-3.26 ve TA: p= 0.61, OR: 0.75, 95% Cl: 0.3-2.0).BH grubunda ise PTPN22 gen polimorfizmine hiç rastlanmadı (p= 0.012, OR:0.65, 95% CI: 0.0-1.1). Hiçbir grupta homozigot polimorfik genotip görülmedi.Tartışma ve sonuçlar: Çalışmamızda PTPN22 polimorfizminin Türkiye'deRA ve TA ile ilişkili olduğu gösterilememiştir. Daha önce yapılan çalışmalardaRA'da HLA-DR ?ortak epitop? alelleri ile ilişkinin diğer popülasyonlara benzerbulunmasına karşın PTPN22 polimorfizmi ile ilişki görülmemesi PTPN22polimorfizminin Asya ülkelerinde olduğu gibi Türkiye'de de çok düşükfrekanslı olmasına bağlanabilir. BH'da ise bu polimorfizmin bulunmamasıkoruyucu bir rolü düşündürebilir.ANAHTAR SÖZCÜKLER: PTPN22 geni, romatoid artrit, Takayasu arteriti,Behçet hastalığı, tek nükleotid polimorfizmi

Introduction: A functional single nucleotide polymorphism (SNP) of PTPN22gene encoding the protein tyrosine phosphatase has been reported to beassociated with autoimmune disorders such as rheumatoid arthritis (RA) andtype I diabetes. PTPN22 encoded protein interacts with the kinases thatmediate T cell activation causing hyper-responsiveness of T cells to stimuli.PTPN22 R620W has a wide variation of allele frequencies among differentpopulations, polymorphic allele being highest in Scandinavia, whereas it isabsent in Asian and African populations. In this study the association ofPTPN22 R620W with RA, Takayasu?s Arteritis (TA) and Behcet?s disease(BD) is investigated in Turkey.Material and Methods: 167 patients with RA (25 men/142 women, meanage: 52.1±11.7 years), 181 patients with TA (19 men/162 women, mean age:37±11.7 years), 134 patients with BD (71 men/63 women, mean age:32.8±9.7 years) and 177 healthy controls (86 men/91 women, mean age:40,6 ± 9.7 years) were genotyped by PCR-RFLP method for the SNP(rs2476601, A/G) of PTPN22 gene. Polymorphic region was amplified byPCR and digested with XcmI enzyme. Genotype frequencies between thegroups were compared by k-square test.Findings: Frequencies of heterozygous genotype (AG) was 5.1% (9/177) inthe control group, 6.6 % (11/167) in RA and 3.8% (7/181) in TA. Nosignificant difference between the RA, TA and control groups (p=0.55, OR:1.3, 95% CI: 0.53-3.26 and p=0.61, OR: 0.75, 95% Cl: 0.3-2 respectively)was detected. When compared according to the presence of rheumatoidfactor (RF), there was also no significant difference between the patients withheterozygous or wild genotypes. In BD group this SNP of PTPN22 was notfound (p=0.012, OR: 0.65, 95% confidence interval: 0.0-1.1). Homozygouspolymorphic genotype was not found in any group.Discussion and Conclusion: PTPN22 polymorphism is not associated withRA and TA in Turkey. This was unexpected as HLA-DR ?shared epitope?association with RA was previously demonstrated in Turkey similar to otherCaucasian populations. Absence of this polymorphism in BD might beassociated with a protective effect in this disease.KEYWORDS: PTPN22 gene, rheumatoid arthritis, Takayasu?s Arteritis,Behcet?s disease, single nucleotide polymorphism