Sığırlardan izole edilen trichophyton verrucosum suşlarının kültür yöntemi ile identifikasyonu ve MALDI TOF-MS ile doğrulanması

Abstract

Trichophyton verrucosum, sığır dermatofitozuna neden olan en önemli etkendir. Derilezyonları, genç sığırlarda gelişmede gerileme, süt sığırlarında sütte azalma, derininekonomik değerinin azalması gibi önemli sorunlara neden olmaktadır. Etkentanımlamada direkt mikroskobik inceleme ve kültür, geleneksel konvansiyonelyöntemlerdir. Standart konvansiyonel yöntemler zaman alıcı olması ve kesin sonuçlarvermemesinden dolayı duyarlılığı ve özgüllüğü yüksek, hızlı yeni tanı yöntemlerineihtiyaç bulunmaktadır. Bu çalışmada sığırlardan Trichophyton verrucosum izolasyonuve MALDI TOF-MS ile doğrulanması amaçlanmıştır. Dermatofitoz şüpheli 100 adetsığırdan alınan deri kazıntısı ve kıl örnekleri direkt mikroskopi yöntemi ile incelenmişve 52 (%52)'si pozitif bulunmuştur. Numunelerin kültür yöntemi ile incelenmesisonucunda 63(%63)'ünde dermatofit izole edilmiş ve bunların 52 (%52)'siT.verrucosum olarak identifiye edilmiştir. Bütün Trichophyton verrucosum izolatlarının7950-7954 arasında MALDI TOF-MS spektrum pikleri saptanarak, doğrulanmıştır.Sonuç olarak, Şanlıurfa bölgesinde sığırlarda T. verrucosum'un yaygın olduğu, MALDITOF-MS tekniğinin T.verrucosum'un teşhisinde geleneksel yöntemlere göre başarılı birşekilde kullanılabileceği belirlendi.Anahtar kelimeler: Trichophyton verrucosum, sığır, MALDI TOF-MS

Trichophyton verrucosum, is the most important causative agent for cattledermatophytosis. It causes skin lesions, growth retardation in young cattle, decline inmilk production, reduction economic value of leather. Direct microscopy and culture areconventional methods for agent identification. Standard conventional methods are timeconsuming and they might not be very definitive and therefore it is needed the new andfast diagnostic techniques that have high sensitivity and specificity. In this study, theisolation of Trichophyton verrucosum from cattle and confirmation with MALDI TOFMSof the isolated strains were aimed. Skin scrapings and hair samples collected from100 were examined by direct microscopy and 52 (52%) of them were found as positive.At the end of cultural studies, 63 (63%) dermatophytosis agents were isolated and 52 ofthem were identified as T.verrucosum. All Trichophyton verrucosum isolates showedMALDI TOF-MS peaks between 7950 and 7954 and these results confirmed theTrichophyton verrucosum isolation.As conclusion, it was determined that Trichophyton verrucosum infection was commonin Şanlıurfa Region and MALDI TOF-MS technique could be used sucessfullycompared to conventional techniques for diagnosis of T.verrucosum.Keywords: Trichophyton verrucosum, cattle, MALDI TOF-MS