dc.contributor.advisor | Ekşi, Fahriye | |
dc.contributor.author | Gayyurhan, Efgan Doğan | |
dc.date.accessioned | 2020-12-07T10:31:52Z | |
dc.date.available | 2020-12-07T10:31:52Z | |
dc.date.submitted | 2009 | |
dc.date.issued | 2018-08-06 | |
dc.identifier.uri | https://acikbilim.yok.gov.tr/handle/20.500.12812/132117 | |
dc.description.abstract | Gaziantep Üniversitesi Tıp Fakültesi Şahinbey Araştırma Hastanesi'nin değişik kliniklerinden Mikrobiyoloji laboratuarına gönderilen çeşitli klinik örneklerden izole edilen 200 Candida suşu değerlendirmeye alınarak, virülans faktörleri ve antifungal duyarlılıkları araştırıldı.Candida suşlarının tür düzeyinde tanımlanması için germ tüp testi, mısırunu-Twen 80 besiyerinde mikroskobik görünüm, Candida ID 2 agarda koloni renginin incelenmesi gibi klasik yöntemler ile birlikte API ID 32C (bioMerieux, Fransa) identifikasyon kiti kullanıldı.Candida kökenlerinin proteinaz üretiminin incelenmesi için sığır serum albumin agar, fosfolipaz üretimi için yumurta sarılı agar, esteraz üretimi için Tween 80 agar ve slime üretimi için modifiye tüp aderans yöntemi kullanıldı. Kökenlerin amfoterisin B, flukonazol, vorikonazol ve kaspofungine duyarlılıkları, CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute)'ın M27-A3 dokümanındaki referans buyyon mikrodilüsyon yöntemi kullanılarak araştırıldı ve her bir ilaç için MİK aralıkları, MİK50 ve MİK90 değerleri belirlendi.İzole edilen 200 Candida suşunun 106'sı (%53) C.albicans, 49'u (%24.5) C.parapsilosis, 15'i (%7.5) C.tropicalis, 9'u (%4.5) C.krusei, 8'i (%4) C.kefyr, 4'ü (%2) C.glabrata, 4'ü (%2) C.famata, 3'ü (%1.5) C.lusitaniae, 2'si (%1) C.guilliermondii olarak identifiye edildi.Candida albicans suşlarının %79.2'si, albicans dışı Candida suşlarının %20.2'si proteinaz olumlu, C.albicans suşlarının %95.3'ü, albicans dışı Candida suşlarının %1.1'i fosfolipaz olumlu, C.albicans suşlarının %96.2'si, albicans dışı Candida suşlarının %34'ü esteraz olumlu idi. C.albicans suşlarının proteinaz, fosfolipaz ve esteraz aktiviteleri, albicans dışı Candida'lara göre anlamlı derecede yüksek bulundu (p<0.05). Bununla birlikte, C.albicans suşlarının %9.4'ü, albicans dışı Candida suşlarının %51.1'i slime olumlu bulundu. Albicans dışı Candida'ların slime aktivitesi, C.albicans suşlarına göre anlamlı derecede yüksek bulundu (p<0.05).Antifungal ilaçların MİK aralıkları amfoterisin B için 0.03-1 ?g/mL, flukonazol için 0.125-?64 ?g/mL, vorikonazol için 0.03-16 ?g/mL, kaspofungin için 0.015-0.25 ?g/mL idi. Candida suşlarının tümü amfoterisin B ve kaspofungine duyarlı idi. İzolatların 33'ü (%16.5) flukonazole dirençli, 12'si doza bağlı duyarlı bulundu. Sekiz (%4) izolat vorikonazole dirençli iken, 4 (%2) izolat doza bağlı duyarlı idi.Virülans faktörleri ile antifungal direnç arasındaki ilişki incelendiğinde, albicans dışı Candida suşlarında, esteraz aktivitesi ile vorikonazol direnci arasında ve slime aktivitesi ile flukonazol direnci arasında anlamlı bir ilişki saptanmıştır (p<0.05). | |
dc.description.abstract | Two-hundred of Candida strains were isolated from various clinical specimens which were sent to the microbiology laboratory of Gaziantep University, Medical Faculty, Şahinbey Research Hospital from various clinics and their virulence factors and antifungal susceptibilities were evaluated.Candida strains were identified to species level by using germ tube test, microscopic evaluation on cornmeal-Tween 80 agar, determination of colour of colonies on Candida ID 2 agar and API ID 32C (bioMerieux, France) identification kits. For investigation of proteinase production of Candida strains, bovine serum albumine agar, for phospholipase production egg yolk agar, for esterase activity Tween 80 agar and for slime activity modified tube adherence method were used. The susceptibilities of the strains to amphotericin B, fluconazole, voriconazole, and caspofungin were evaluated by using reference broth microdilution method as described on M27-A3 document of CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute). Additionally, MIC ranges, MIC50 and MIC90 values for each drug were determinated.Of the total 200 Candida strains, 106 (53%) were identified as C.albicans, 49 (24.5%) were C.parapsilosis, 15 (7.5%) were C.tropicalis, 9 (4.5%) were C.krusei, 8 (4%) were C.kefyr, 4 (2%) were C.glabrata, 4 (2%) were C.famata, 3 (1.5%) were C.lusitaniae, and 2 (1%) were C.guilliermondii.For proteinase, 79.2% of C.albicans and 20.2% of non-albicans strains, for phospholipase 95.3% of C.albicans and 1.1% of non-albicans strains, for esterase 96.2% of C.albicans and 34% of non-albicans strains were positive. Proteinase, phospholipase and esterase production of C.albicans strains were higher than non-albicans Candida strains which was statistically significant (p<0.05). For slime activity while 9.4% of C.albicans strains were positive, 51.1% of non-albicans strains were positive, thus slime production of non-albicans strains were higher than that of C.albicans strains (p<0.05).MIC ranges for amphotericin B were determinated as 0.03-1 ?g/mL, for fluconazole 0.125-?64 ?g/mL, for voriconazole 0.03-16 ?g/mL, and for caspofungin 0.015-0.25 ?g/mL. All Candida strains were susceptible to amphotericin B and caspofungin. Thirty-three (16.5%) isolates were resistant to fluconazole, and 12 (6%) isolates were susceptible dose-dependent. Eight (4%) isolates were resistant to voriconazole, and four (2%) isolates were susceptible dose-dependent.As conclusion, when we investigated the relationship between virulence factors and antifungal resistance, we found out that in non-albicans Candida strains there were both significant relationship between esterase activity and voriconazole resistance, and slime production and fluconazole resistance (p<0.05). | en_US |
dc.language | Turkish | |
dc.language.iso | tr | |
dc.rights | info:eu-repo/semantics/embargoedAccess | |
dc.rights | Attribution 4.0 United States | tr_TR |
dc.rights.uri | https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ | |
dc.subject | Mikrobiyoloji | tr_TR |
dc.subject | Microbiology | en_US |
dc.title | Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Candida türlerindeki virülans faktörlerinin araştırılması ve antifungal duyarlılıklarının değerlendirilmesi | |
dc.title.alternative | Evaluation of Virulence factors and antifungal susceptibilities of Candida species isolated from various clinical specimens | |
dc.type | doctoralThesis | |
dc.date.updated | 2018-08-06 | |
dc.contributor.department | Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı | |
dc.subject.ytm | Candida | |
dc.subject.ytm | Candida albicans | |
dc.subject.ytm | Virulence | |
dc.subject.ytm | Antifungal agents | |
dc.subject.ytm | Antifungal sensitivity tests | |
dc.subject.ytm | Drug hypersensitivity | |
dc.identifier.yokid | 334373 | |
dc.publisher.institute | Tıp Fakültesi | |
dc.publisher.university | GAZİANTEP ÜNİVERSİTESİ | |
dc.type.sub | medicineThesis | |
dc.identifier.thesisid | 236351 | |
dc.description.pages | 132 | |
dc.publisher.discipline | Diğer | |